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[GROMACS] GPU加速版本中,如何设置 -ntmpi和-ntomp才能使运行效率最高呢

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楼主
在GPU加速版本中,如何设置 -ntmpi(thread_MPI线程数)和-ntomp(OpenMP线程数)才能使运行效率最高呢,设置-pin on将线程和内核绑定会不会影响计算效率呢?

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所念皆星河

2#
发表于 Post on 2022-9-22 09:57:01 | 只看该作者 Only view this author
论坛里有大佬们做过测试,看
《GROMACS (2019.3 GPU版) 并行效率测试及调试思路》 (http://bbs.keinsci.com/thread-13861-1-1.html
《分享最近给某超算平台GPU节点做的Benchmark》(http://bbs.keinsci.com/thread-30061-1-1.html
你也可以用自己的体系做benchmark,那样得出的结论会更适合你的实际情况。
心之所向,日复一日,必有精进

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