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楼主 Author: chuan437
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[新手求助] 两个距离很远的分子能量是否等于两个单体分子能量之和

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发表于 Post on 2022-10-7 22:57:51 | 只看该作者 Only view this author
chuan437 发表于 2022-10-5 21:54
结构不一样,但是考虑距离很远交互作用很小,可近似为单体能量之和,我是这样想的。

首先要保证复合物里两个单体的几何结构 与 孤立的两个单体的几何结构一致,然后再讨论相加能量等不等的问题,然后才是SCF是否收敛到什么解的问题(这不是什么难题,如果你保证了结构的统一,届时还算出不对应的解,可以上传输入文件,我们可以较为轻松地帮你算出来)。讨论多因素问题时建议先控制变量,便于对问题一击即中。

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chuan437 + 4 谢谢
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-7 23:11:06 | 只看该作者 Only view this author
Childhood 发表于 2022-10-6 23:26
从下面那个稠环体系的氢个数来说,感觉至少带了两个自由基。所以可能,在整体的能量最小状态下的波函数,不 ...

你好,这是截取的簇模型,周围的是悬挂键饱和氢。

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发表于 Post on 2022-10-8 03:01:10 | 只看该作者 Only view this author
chuan437 发表于 2022-10-7 16:11
你好,这是截取的簇模型,周围的是悬挂键饱和氢。

如果要截取石墨烯的话,光注意补氢的问题还不够,还要注意让这个结构能画出单双键交替、没有自由基的共振式。像你现在这种截法,你去画它的共振式,会发现无论如何都会有两个碳上有自由基,这样会高估石墨烯的反应性(比如高估它向过硫酸转移电子的能力),因为真实的石墨烯在基态时是没有自由基的。
此外还有一个次要问题,就是尽量让所有碳都成环,不要有CH2这种基团,不然也会高估石墨烯的反应性,比如本来过硫酸跟石墨烯可能不太容易反应,但你搞了一个端烯的基团在里面,可能分分钟就被环氧化了,也就是说你会高估石墨烯被过硫酸氧化成氧化石墨烯的容易程度。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-8 11:15:06 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-10-8 03:01
如果要截取石墨烯的话,光注意补氢的问题还不够,还要注意让这个结构能画出单双键交替、没有自由基的共振 ...

学习了,

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