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[VMD] 使用Tachyon渲染的结果为什么改变颜色?

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如图1是在OpenGL中显示的颜色,当我用Tachyon渲染以后,核酸有一部分从黄色变成了红色(图2)。请问出现这样的原因是什么?该如何解决呢?

202210081052558534..png (69.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 10)

图2

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202210081051578695..png (71.83 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

图1

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发表于 Post on 2022-10-8 12:58:41 | 只看该作者 Only view this author
图 2 红色的这部分原子重复了,请检查坐标
十八介姑娘一蕾花呀,白白介牙齿、红红介嘴唇,得人惜

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发表于 Post on 2022-10-8 19:26:56 | 只看该作者 Only view this author
因为两个rep都有这一段区域,而且二者显示方式相同而颜色不同,因此哪种颜色会实际显示出来有任意性
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-12 11:40:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-10-8 19:26
因为两个rep都有这一段区域,而且二者显示方式相同而颜色不同,因此哪种颜色会实际显示出来有任意性

谢谢老师,请问如何解决呢?因为黄色的部分是RNA,红色的部分是蛋白结构域,重叠的是蛋白的一个残基,不清楚为什么发生了这样的重叠,可以删除这个孤立的残基吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-12 11:41:25 | 只看该作者 Only view this author
王二葛 发表于 2022-10-8 12:58
图 2 红色的这部分原子重复了,请检查坐标

谢谢。

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发表于 Post on 2022-10-12 12:36:06 | 只看该作者 Only view this author
sxwen 发表于 2022-10-12 11:40
谢谢老师,请问如何解决呢?因为黄色的部分是RNA,红色的部分是蛋白结构域,重叠的是蛋白的一个残基,不 ...

VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html

看上文,反复调节选择区域,自然就能搞明白
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-12 16:45:13 | 只看该作者 Only view this author
好的,谢谢老师

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