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[新手求助] 怎么建立ZSM-5分子筛团簇模型

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我的研究方向是ZSM-5分子筛上烯烃的异构芳构。刚开始接触分子模拟,完全就是个小白。不知道怎么建模型。像下面这样的34T团簇模型是用gaussview画的么?怎么画呢?

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发表于 Post on 2016-5-17 19:43:57 | 只看该作者 Only view this author
你可以找分子筛的cif文件,在此基础上选取合适的部分,删除其余的原子
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-5-17 22:44:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-5-17 19:43
你可以找分子筛的cif文件,在此基础上选取合适的部分,删除其余的原子

      MS里面就有ZSM5,直接调用即可。import,catalyst里面最后一个就是ZSM5。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-5-18 09:38:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-5-17 19:43
你可以找分子筛的cif文件,在此基础上选取合适的部分,删除其余的原子

嗯嗯,竟然被老师回复了,好开心

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-5-18 09:39:38 | 只看该作者 Only view this author
liu_tiao 发表于 2016-5-17 22:44
MS里面就有ZSM5,直接调用即可。import,catalyst里面最后一个就是ZSM5。

好哒,我去下载一个,谢谢师兄

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发表于 Post on 2016-11-28 16:46:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-5-17 19:43
你可以找分子筛的cif文件,在此基础上选取合适的部分,删除其余的原子

Sob老师,继续请教下。文献上说MFI分子筛有12个T位,然后构建TS-1分子筛时考虑每个T位分别作为钛原子的落点,然后截取诸如7T、34T这些团簇模型。我查阅了一些文献,发现我在ms里打开时候用name可以显示各个T位,但是放到gaussianview里就认不出来了,所以想请教:1、ms里是否可以直接以某个T位的Si出发,往四周选择一部分原子?2、到底怎么去识别这些T位,我看了好多文献,也没找到出处,谢谢您

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发表于 Post on 2023-11-16 11:03:38 | 只看该作者 Only view this author
bmwbush 发表于 2016-11-28 16:46
Sob老师,继续请教下。文献上说MFI分子筛有12个T位,然后构建TS-1分子筛时考虑每个T位分别作为钛原子的落 ...

请问找到解决办法了吗

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发表于 Post on 2023-12-3 11:11:23 | 只看该作者 Only view this author
加油毕业 发表于 2023-11-16 11:03
请问找到解决办法了吗

把想要的那个T位的原子改成别的原子,再保存就行了。

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