求助文献中过渡态能量曲线图的几个问题

fight · 发表于 Post on 2022-10-20 15:39:48

请教一下，该图是如何定义的能量零点，此反应的反应物有两个，那么初态的能量是如何定义的，应该不是两个反应物能量的加和作为能量零点吧？R' 的能量是怎样得到的？如果使用给出生成物和反应物的方法进行过渡态搜索，那么是给出R和P，还是R' 和P' ? 谢谢！

Strange · 发表于 Post on 2022-10-20 21:30:07

本帖最后由 Strange 于 2022-10-20 21:31 编辑

两个反应物能量的加和作为能量零点； R'就是复合物的能量（应该是跑IRC再优化出来的）；R'（不用跟复合物完全一样，差不多就行）和P' （或P），不过不建议用QST2

sobereva · 发表于 Post on 2022-10-20 23:52:49

补充一点，注意区分电子能量和自由能
R'（反应复合物）的电子能量比R（两个单体能量相加）低，但自由能更高

fight · 发表于 Post on 2022-10-21 18:01:19

本帖最后由 fight 于 2022-10-21 18:02 编辑

sobereva 发表于 2022-10-20 23:52
补充一点，注意区分电子能量和自由能
R'（反应复合物）的电子能量比R（两个单体能量相加）低，但自由能更 ...

感谢您的回复，您好，这个图为什么出现了R' 的能量比R要低？图中给出的是自由能还是电子能量？谢谢！

sobereva · 发表于 Post on 2022-10-21 18:22:46

fight 发表于 2022-10-21 18:01
感谢您的回复，您好，这个图为什么出现了R' 的能量比R要低？图中给出的是自由能还是电子能量？谢谢！

是什么能量文中都会写明，仔细看

电子能量R'一定比R更低，否则根本都优化不出来。

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[新手求助] 求助文献中过渡态能量曲线图的几个问题