求助金属氧化物表面吸附NH3分子的构型优化结构变化有点大

littleyang · 发表于 Post on 2022-10-22 15:10:42

各位大佬我请教一个问题
我在做吸附模型的结构优化时，优化前后的结构变化有点大，可以帮我看看这正常吗

我用的Dmol3，金属氧化物表面吸附NH3分子，金属氧化物表面最下层原子固定

kkxcxx · 发表于 Post on 2022-10-22 16:43:26

模型太小，跑散了。dmol3几何优化常见

littleyang · 发表于 Post on 2022-10-22 16:59:54

kkxcxx 发表于 2022-10-22 16:43
模型太小，跑散了。dmol3几何优化常见

那我应该怎么办呢，我是该调节优化参数吗
这种情况下，如果不改变的话算出来的结果可以用嘛（比如吸附能）

sobereva · 发表于 Post on 2022-10-22 18:55:48

如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “吸附构型优化” 改了，以后务必注意，下次将删帖+扣分处理。

kkxcxx · 发表于 Post on 2022-10-22 19:57:01

littleyang 发表于 2022-10-22 16:59
那我应该怎么办呢，我是该调节优化参数吗
这种情况下，如果不改变的话算出来的结果可以用嘛（比如吸附能 ...

晶胞更厚更大一点，受力干扰会小，扩大vaccum层也可以适当避免。取舍吧，大体系算的也会慢一些

lyf1223 · 发表于 Post on 2022-10-23 12:47:02

本帖最后由 lyf1223 于 2022-10-23 15:49 编辑

我最近也在做这个吸附构型，不过用的ms建模，vasp计算
首先我认为可以考虑你扩的这个真空层大小，因为分子间的范德华作用力的范围比较大，需要设置一个比较大的范围。
其次可以考虑摆放位置是否合理。
然后再考虑参数的问题
这是我的理解，dmol我不清楚，学的只是皮毛一点点，可以互相讨论，也希望后来大佬能够批评指正

littleyang · 发表于 Post on 2022-10-23 12:57:07

lyf1223 发表于 2022-10-23 12:47
我最近也在做这个吸附构型，不过用的ms建模，vasp计算
首先我认为可以考虑你扩的这个真空层大小，因为氢键 ...

好的，改变一下真空层试试，谢谢您的建议

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[CASTEP/Dmol3/MS] 求助金属氧化物表面吸附NH3分子的构型优化结构变化有点大

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