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[Multiwfn使用咨询] Multiwfn绘制ICSS问题

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老师您好!请问我用Multiwfn绘制化学屏蔽表面ICSS时,参数设置全部按照通过Multiwfn绘制等化学屏蔽表面(ICSS)研究芳香性 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)。最后出来的图是下面这种情况,分子体系也不大,3D图竟然被截断了,可能是延展距离设为12太小了?应该设为多少,或者有其它问题?烦请不吝赐教!

dislin_1.png (633.51 KB, 下载次数 Times of downloads: 22)

3D图

3D图

dislin.png (47.4 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

平面图(被截断)

平面图(被截断)

Snipaste_2022-10-26_18-26-00.png (59.21 KB, 下载次数 Times of downloads: 20)

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发表于 Post on 2022-10-27 06:52:14 | 只看该作者 Only view this author
等值面数值(isovalue)设的不合理。数值太小的情况,等值面极度弥散,哪怕很大的延展距离也不够用。之前没用ICSS研究过别的体系的话,强烈建议先把我博文里的苯分子的例子完整重复一遍。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-27 08:51:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-10-27 06:52
等值面数值(isovalue)设的不合理。数值太小的情况,等值面极度弥散,哪怕很大的延展距离也不够用。之前没用 ...

好的,谢谢!

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发表于 Post on 2022-10-27 09:56:04 | 只看该作者 Only view this author
截图请截全,dislin_1.png 图旁边还有调节窗口,也截在同一张图里就更好说明问题。

你可以手动调节 isovalue 值,同时观察等值面的变化。调节到看起来合理就可以了。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-27 11:58:23 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2022-10-27 09:56
截图请截全,dislin_1.png 图旁边还有调节窗口,也截在同一张图里就更好说明问题。

你可以手动调节 isov ...

感谢二位!等值面图已调好,是isovalue设的太小的问题。在绘制平面图中,将color scale设为-5,40,右边刻度出现重叠,请问如何调节刻度之间的范围呢?

202210271157593248..png (163.8 KB, 下载次数 Times of downloads: 22)

右侧刻度重叠

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发表于 Post on 2022-10-27 12:01:16 | 只看该作者 Only view this author
lycheeho 发表于 2022-10-27 11:58
感谢二位!等值面图已调好,是isovalue设的太小的问题。在绘制平面图中,将color scale设为-5,40,右边刻 ...

菜单里直接就提供了选项修改色彩刻度(Z轴)标签间隔,仔细看一遍选项便知
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-27 12:10:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-10-27 12:01
菜单里直接就提供了选项修改色彩刻度(Z轴)标签间隔,仔细看一遍选项便知

看到了,谢谢~

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发表于 Post on 2022-11-28 09:15:58 | 只看该作者 Only view this author
lycheeho 发表于 2022-10-27 11:58
感谢二位!等值面图已调好,是isovalue设的太小的问题。在绘制平面图中,将color scale设为-5,40,右边刻 ...

您好,请问这个isovalue数值是在哪里调节的呢?

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发表于 Post on 2022-11-28 09:27:52 | 只看该作者 Only view this author
ttzb 发表于 2022-11-28 09:15
您好,请问这个isovalue数值是在哪里调节的呢?

Multiwfn绘制等值面图的图形界面的右侧,有明确提示
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