计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 2532|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] Gaussian模拟电场下有机物和自由基反应,求过渡态的操作步骤

[复制链接 Copy URL]

52

帖子

0

威望

229

eV
积分
281

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主

各位老师好,我用Gaussian模拟电场下有机物和自由基反应,以苯酚和羟基为例。求过渡态的步骤是这样的吗?1、在电场下分别对苯酚和羟基做结构优化 2、在电场下,将优化后的苯酚和羟基放一起求过渡态。下面是我求过渡态的输入文件,电场强度1万v/m,不知道对不对,请老师指教。

%chk=D:\Gaussian\keti\b\dianchang\D-benfen-opt-ts.chk
%nprocshared=4
%mem=1400MB
#p opt=(calcfc,ts,noeigen) freq 6-31+g(d,p) scrf=(iefpcm,solvent=water) nosymm field=read
int=ultrafine um062x

Title Card Required

0 2
C                 -0.16343166   -1.15943727    0.20928053
C                  1.22856534   -1.12507927    0.20927653
C                  1.91084034    0.09358573    0.20927553
C                  1.18297534    1.28301073    0.20927653
C                 -0.21164066    1.26286673    0.20927853
C                 -0.88177166    0.03808873    0.20928253
O                 -2.24369366   -0.05016927    0.20927953
H                 -0.70462566   -2.10014227    0.20928353
H                  1.78291734   -2.05850427    0.20927453
H                  1.69868134    2.23827973    0.20927553
H                 -0.77690366    2.19096873    0.20927553
H                 -2.63738766    0.83191973    0.20933653
O                  2.33558234    0.15552095    2.29117760
H                  1.38809992    0.16237848    2.53009492
H                  2.95925731    0.12635174   -0.00202583

0.00000002 0.00000000 0.00000000




6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125127

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2022-10-31 15:27:53 | 只看该作者 Only view this author
分别优化没意义,除非一开始手画的单体结构过于离谱

其它的没问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

52

帖子

0

威望

229

eV
积分
281

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-31 16:04:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-10-31 15:27
分别优化没意义,除非一开始手画的单体结构过于离谱

其它的没问题

多谢社长

1万

帖子

0

威望

9855

eV
积分
22090

Level 6 (一方通行)

4#
发表于 Post on 2022-10-31 17:16:01 | 只看该作者 Only view this author
电场这么小的话,说实话我觉得不会对反应有什么影响,比如看https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/wcms.1438,基本上电场强到0.001au左右才会对反应有显著影响。你这个反应还不直接涉及离子,受电场影响估计更小。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

52

帖子

0

威望

229

eV
积分
281

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-1 09:23:10 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-10-31 17:16
电场这么小的话,说实话我觉得不会对反应有什么影响,比如看https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/ep ...

嗯,我逐步加大电场看看,谢谢老师

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-19 12:05 , Processed in 0.243361 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list