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[新手求助] 请教结合能和结合自由能计算值正负的问题

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本帖最后由 junhaowang 于 2022-11-6 22:26 编辑

各位老师好,我在计算A+2B→AB2的结合能和结合自由能时出现如下问题。(1)使用B3LYP-D3/6-311G*A、B和AB进行结构优化和频率计算,然后使用M06-2X-D3/Jul-cc-pvtz对优化的结构进行单点能计算。根据公式ΔE=E(AB2)-E(A)-2E(B),得到的ΔE为负值,见图1。
(2)计算结合自由能时,将M06-2X-D3/Jul-cc-pvtz级别下得到的单点能(E)加上B3LYP-D3/6-311G*级别下的Gcorr得到G。根据公式ΔG=G(AB2)-G(A)-2G(B),得到的ΔG为正值,见图2。
(3)使用Sob老师提出的Shermo程序,并严格按照http://sobereva.com/552提供的教程进行计算,根据公式ΔG=G(AB2)-G(A)-2G(B),ΔG结果为正值,与图2值近似。
烦请老师们帮忙解答,谢谢。
图1


图2




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发表于 Post on 2022-11-6 22:42:58 | 只看该作者 Only view this author
化合反应一般是熵减过程,delta S为负,是有可能delta E为负但delta G为正。
ORCA大法好!CP2K大法好!
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山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-7 09:59:31 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-11-6 22:42
化合反应一般是熵减过程,delta S为负,是有可能delta E为负但delta G为正。

老师你好,ΔG为正值就意味着非自发反应,就没法通过计算结合自由能来说明A与B的结合反应了是吧?

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发表于 Post on 2022-11-7 10:38:39 | 只看该作者 Only view this author
junhaowang 发表于 2022-11-7 09:59
老师你好,ΔG为正值就意味着非自发反应,就没法通过计算结合自由能来说明A与B的结合反应了是吧?

可以讨论deltaG怎么受温度影响,特定温度以上为正,不能自发结合;特定温度以下为负,能结合

我的这篇文章有一部分研究了OPP与18碳环结合的温度依赖性问题,可以参考:
18碳环与oligoparaphenylene (OPP)形成的新颖的双马达纳米转子复合物的量子化学和分子动力学研究:Zeyu Liu,* Xia Wang, Tian Lu,* et al., Novel dual-motor nanorotator assembled by cyclo[18]carbon and figure-eight carbon hoop, ChemRxiv (2022) DOI: 10.26434/chemrxiv-2022-lb0dt
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-7 10:50:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-11-7 10:38
可以讨论deltaG怎么受温度影响,特定温度以上为正,能自发结合;特定温度以下为负,不能结合

我的这篇 ...

谢谢Sob老师,我看一下您的文章。

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