计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1595|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[波函数分析求助] 如何解释电子密度差图中离子周围出现正负交替的圈

[复制链接 Copy URL]

111

帖子

0

威望

2559

eV
积分
2670

Level 5 (御坂)

各位老师好,
本人在做铅离子Pb2+在吲哚上吸附前后的电子密度差平面图时(Pb2+在苯环中心上方),Pb2+周围从内往外出现蓝-红-蓝-红交替的圈,意即与苯环相互作用之后从内往外为电子密度减少-增加-减少-增加的轨道,请问如何解释这一现象?
Pb2+有80个电子,原子轨道为1s2 2s2 2p6 3s2 3p6 3d10 4s2 4p6 4d10 4f14 5s2 5p6 5d10 6s2 6p0,我使用的基组为Stuttgart的小核赝势版本MDF60,即60个电子被赝化(...4f14),剩下表现出来的电子为5s2 5p6 5d10 6s2 6p0,进行Mulliken布居分析显示Pb的各壳层布居数为 S:4.004,P:6.5479,D:10.04,F: 0.0303,G: 0.0007,H: 0.0000,未见电子数减小的轨道,且电子密度增加的主要是铅离子的p轨道(6→6.5479),因此,能否认为Pb2+周围内层红色部分为Pb的5p轨道,外层红色部分为Pb的6p轨道?






6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2022-11-7 10:42:45 | 只看该作者 Only view this author
用Multiwfn参考下文计算一下各个主量子数各个角量子数壳层的电子布居数的变化就清楚了,不需要靠猜,参考
利用布居分析判断基函数与原子轨道的对应关系
http://sobereva.com/418http://bbs.keinsci.com/thread-10094-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

111

帖子

0

威望

2559

eV
积分
2670

Level 5 (御坂)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-8 11:05:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-11-7 10:42
用Multiwfn参考下文计算一下各个主量子数各个角量子数壳层的电子布居数的变化就清楚了,不需要靠猜,参考
...

感谢老师的回答,
按照博文的做法考察了Pb2+在吸附前后各壳层的Mulliken电子布居(当前基组下Pb2+被表现出来的电子为 5s2 5p6 5d10 6s2 6p0),如下图,我发现电子布居增加的主要是Pb2+的5p和6p轨道,基本可以判断电子密度差图中外层两圈电子密度增加的区域为Pb2+的5p和6p轨道,但没有电子布居减小的轨道,不知道为什么电子密度差图中Pb2+周围会出现电子密度减小的区域?

另外想请教几个小问题,
1.布居分析只能看到没有被赝化的轨道的电子布居,内层电子如4p,4s,3s等的电子布居如何变化就没办法得到了,所以最佳的做法是不是用全电子基组进行分析?

2.因为我这里是二价铅离子,共82-2=80个电子,所以还是和80号原子有区别,铅离子有6p轨道,只是6p轨道上没有电子,第80号原子没有6p轨道。所以进行布居分析时,P壳层也包括6p轨道在内,对吗?

3.相互作用之后Pb2+的F壳层出现的电子(图右下角)是否是4f轨道,但我用的MDF60赝势是把4f的全部14个电子给赝化了,还能表现出来吗?




6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2022-11-8 12:05:34 | 只看该作者 Only view this author
wudiazhu 发表于 2022-11-8 11:05
感谢老师的回答,
按照博文的做法考察了Pb2+在吸附前后各壳层的Mulliken电子布居(当前基组下Pb2+被表现 ...

1 当前用的赝势基组,本身讨论内核电子结构变化就没物理意义。当前内核区域电子结构发生的变化没必要去试图解释。非要考察内核区域,就用全电子基组。

2 6p显然也算P壳层

3 那是F极化函数有一定布居数,体现F极化函数确实对计算结果(能量、电子结构)产生了贡献,但并不是4f原子轨道

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +2 收起 理由
Reason
wudiazhu + 2 谢谢老师!

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-22 07:19 , Processed in 0.317276 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list