基于fch中的Hessian矩阵计算振动频率的简单程序Hess2freq

tiandikuoyuan · 发表于 Post on 2021-7-25 10:23:50

wzkchem5 发表于 2021-7-24 21:50
normal coordinates只有方向是有物理意义的，把整个normal coordinate矢量取负号，不改变任何物理可观测 ...

明白了，谢谢

Kalinite · 发表于 Post on 2022-6-8 16:57:28

sob老师您好！
说明文档中提到：“Gaussian输出最终的振动频率前，会先从3N个频率中自动判断出整体平动和转动模式来，然后将它们对力常数矩阵的贡献投影掉使得振动频率更精确。”这里是如何判断整体平动转动模式的呢，是否也是和这个程序中一样去掉最小的六个。另外这里的投影可以给一下具体的数学表达吗？最近在做一些工作，想把一些笛卡尔坐标系下的矢量转换到内坐标下，对如何删除平动转动自由度感到很是困惑。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-6-8 18:08:30

Kalinite 发表于 2022-6-8 09:57
sob老师您好！
说明文档中提到：“Gaussian输出最终的振动频率前，会先从3N个频率中自动判断出整体平动和 ...

我不知道sob老师的做法是什么，但是一般量化程序的做法并不是对角化以后去掉最小的6个频率，而是先推导出平动和转动模式的解析形式，再把这些模式从Hessian里投影掉，然后对角化剩下的3N-6维的Hessian。这样的好处是假如有振动频率极其小的振动模式，不至于误把这个振动扔掉。

Kalinite · 发表于 Post on 2022-6-8 20:49:54

wzkchem5 发表于 2022-6-8 18:08
我不知道sob老师的做法是什么，但是一般量化程序的做法并不是对角化以后去掉最小的6个频率，而是先推导出 ...

请问您有关于“推导出平动和转动模式的解析形式”这方面的资料吗

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-6-8 20:56:16

Kalinite 发表于 2022-6-8 13:49
请问您有关于“推导出平动和转动模式的解析形式”这方面的资料吗

没有，这个就是经典力学的内容，找一本力学教材看看刚体平动和转动的简正模怎么算就知道了

sobereva · 发表于 Post on 2022-6-9 07:38:06

Kalinite 发表于 2022-6-8 20:49
请问您有关于“推导出平动和转动模式的解析形式”这方面的资料吗

Gaussian有个官方文档Vibrational Analysis in Gaussian，里面有细节

WaterMirror · 发表于 Post on 2022-6-9 08:24:13

Gaussian官方文档Vibrational Analysis in Gaussian

Kalinite · 发表于 Post on 2022-6-9 13:27:26

感谢大家的帮助！

王二葛 · 发表于 Post on 2022-6-10 11:41:15

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[算法与编程] 基于fch中的Hessian矩阵计算振动频率的简单程序Hess2freq

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