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[新手求助] 优化结构对称性的问题

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Level 3 能力者

发表于 Post on 2022-11-29 10:02:51 | 显示全部楼层 Show all |阅读模式 Reading model
各位老师好,本人最近在给别人计算一个分子的时候遇到一个问题特来请教下大家,这个分子从最初的分子结构上是呈现对称性的,可我基态优化出来的结构并不是对称性的结构,且电子云分布也不是想我所想的那样,从HOMO和LUMO来看,是呈现一个左右的电荷转移,我本来认为是HOMO分布于两边的吩硒嗪,而LUMO的话主要分布于中间两边的羰基上,个人认为可能是中间两个羰基和一个亚甲基的空间位阻太大,如果在同一侧呈现对称结构的话可能会结构不稳定。我想问的是,这种情况是否是合理的?如果不对的话,我应该如何调整呢?(好像在gaussview里一个设置对称性,但我并不了解,想向大家学习一下),感谢老师们的回复~

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发表于 Post on 2022-11-29 10:15:27 | 显示全部楼层 Show all
建议贴一下您的输入输出文件(可以打包后上传)
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-29 14:42:12 | 显示全部楼层 Show all
下面给出了分子的输入及输出文件

输入及输出文件.rar

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发表于 Post on 2022-11-29 15:09:26 | 显示全部楼层 Show all
结构式画着是对称的分子,本来空间结构就有可能是不对称的。可能HOMO在左边的构象和HOMO在右边的构象都有,但是单看任何一个构象都是不对称的。类比环己烷,所有构象都有至少两种不等价的氢,但是因为构象之间转变迅速,所以平均下来所有氢化学等价。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-30 19:05:39 | 显示全部楼层 Show all
wzkchem5 发表于 2022-11-29 15:09
结构式画着是对称的分子,本来空间结构就有可能是不对称的。可能HOMO在左边的构象和HOMO在右边的构象都有, ...

感谢老师的回复~

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