利用热力学循环计算能量时，是只对阴离子体系加弥散还是为了保持一致性都需要加

小七丫 · 发表于 Post on 2022-11-29 23:49:35

本帖最后由小七丫于 2022-11-30 00:10 编辑

热力学循环如图所示：结构优化各物质级别一样6-311+g**,对Fe3+用SDD赝势；能量计算时对带负电的配体EDTA4-和络合物Fe3+(EDTA4-）用了def2-TZVPD基组，其余带正电的物质用def2-TZVP基组；请问这样合理吗，还是说因为需要保持一致性所有物质都用def2-TZVPD基组（或者我为了节省时间都不加弥散）。此文献中能量计算用的是Jaguar和Turbomole程序，对不同的金属离子使用全电子基组TZVP或LACV3P基组
文献：[1]Garima, Chauhan, Matthias, et al. The thermodynamics and biodegradability of chelating agents upon metal extraction[J]. Chemical Engineering Science, 2015.

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-11-30 02:18:15

举个例子：EDTA的氧原子在EDTA4-里带负电，所以所有物种里面EDTA的氧原子都需要加弥散，包括和Fe3+络合以后，甚至包括被质子化以后，都需要加弥散。但是EDTA里的其他原子（C、H、N）不用加弥散，其他在整篇文章里都不会带较多负电的氧原子（例如水分子、配位水）也可以不加。
但是假如你结构优化已经按6-311+G**做完了，不想去掉弥散重做的话，会面临一个问题，万一审稿人问”为什么结构优化对C、N加了弥散，单点能反而不加“，不好回答。此时建议给C、N以及其他的O也加上弥散。（当然给结构优化去掉多余的弥散函数重新做也是一个选择）
此外，def2-TZVPD的弥散函数是为极化率等计算而设计的，对于负离子体系的单点能，用ma-def2-TZVP（又称ma-TZVP）性价比高一些

小七丫 · 发表于 Post on 2022-12-7 09:36:39

明白了，我结构优化已经做完了，得用ma对C.N.O加弥散

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[综合交流] 利用热力学循环计算能量时，是只对阴离子体系加弥散还是为了保持一致性都需要加