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[Amber] 求助pymol制作模拟过程动画导入pdb的问题

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发表于 Post on 2022-11-30 09:35:40 | 显示全部楼层 Show all |阅读模式 Reading model
我想用pymol制作动画展示模拟过程,查了一下需要导入很多pdb到一个对象里,就是一个pdb很多个state么?Amber如何实现这一步骤呢?还是说有什么其他的方式?

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发表于 Post on 2022-11-30 10:22:17 | 显示全部楼层 Show all
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “pymol制作模拟过程动画” 改了,以后务必注意
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办最高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班基础(中级)量子化学培训班分子动力学与GROMACS培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的最佳途径。培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-11-30 10:23:19 | 显示全部楼层 Show all
用VMD载入轨迹观看动画或者产生动画文件(如自带的moviemaker工具结合ffmpeg,或者oCam等程序录屏成动画文件)。完全没必要用pymol。VMD是最好的观看动力学轨迹的程序
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