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[CP2K] 求助CP2K计算同一分子不同晶态的能量的两个问题

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发表于 Post on 2022-11-30 10:32:11 | 显示全部楼层 Show all |阅读模式 Reading model
各位老师好,有一个140原子数的有机分子(只有C、H、O),它有三种晶态a、b、c(均有单晶结构),其中a相最稳定。1.现在想要通过能量的角度证明a相能量最低,可否使用CP2K分别计算单个晶胞的总能量来进行对比呢?
2.每相的单胞中都不是完整分子,计算时需要考虑超胞嘛?
谢谢老师回答!
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发表于 Post on 2022-11-30 10:44:33 | 显示全部楼层 Show all
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “CP2K计算同一分子不同晶态的能量” 改了,以后务必注意

1 可以

2 不需要。搞清楚什么叫周期边界条件。
由于当前原胞不够大,计算时记得考虑k点.
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办最高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班基础(中级)量子化学培训班分子动力学与GROMACS培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的最佳途径。培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-30 15:26:45 | 显示全部楼层 Show all
sobereva 发表于 2022-11-30 10:44
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

感谢sob老师,以后标题会注意。
还想请教您,对于该体系的晶胞(250原子左右),用b3lyp-D3 + 6-311G**做结构优化(优化H原子),之后再用def2-TZVP算能量可行吗?

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发表于 Post on 2022-12-1 04:04:39 | 显示全部楼层 Show all
1739140886 发表于 2022-11-30 15:26
感谢sob老师,以后标题会注意。
还想请教您,对于该体系的晶胞(250原子左右),用b3lyp-D3 + 6-311G** ...

如果考虑k点,CP2K此时没法用杂化泛函
PBE-D3(BJ)/DZVP-MOLOPT-SR-GTH考虑k点做优化就完了
CP2K里适合用的基组和量化程序有天壤之别。算能量用TZVP-MOLOPT-GTH
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-1 09:59:09 | 显示全部楼层 Show all
sobereva 发表于 2022-12-1 04:04
如果考虑k点,CP2K此时没法用杂化泛函
PBE-D3(BJ)/DZVP-MOLOPT-SR-GTH考虑k点做优化就完了
CP2K里适合 ...

好的,感谢sob老师回复!学到了!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-1 14:46:14 | 显示全部楼层 Show all
sobereva 发表于 2022-12-1 04:04
如果考虑k点,CP2K此时没法用杂化泛函
PBE-D3(BJ)/DZVP-MOLOPT-SR-GTH考虑k点做优化就完了
CP2K里适合 ...

sob老师,还有一个关于k点的问题想请教您。
我第一次进行有关周期性体系的计算,a、b、c三个晶胞的尺寸和空间群都不一样,那么k点设置可以相同吗(比如5,5,5)?

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发表于 Post on 2022-12-2 02:29:35 | 显示全部楼层 Show all
1739140886 发表于 2022-12-1 14:46
sob老师,还有一个关于k点的问题想请教您。
我第一次进行有关周期性体系的计算,a、b、c三个晶胞的尺寸 ...

这种情况都应当用足够大、大到足矣令各自能量随k点增加达到收敛的k点数。可以对每个体系都做个k点收敛性测试
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-2 11:49:37 | 显示全部楼层 Show all
sobereva 发表于 2022-12-2 02:29
这种情况都应当用足够大、大到足矣令各自能量随k点增加达到收敛的k点数。可以对每个体系都做个k点收敛性 ...

好的,感谢sob老师!

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