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[Gaussian/gview] gaussian报错The name of the center is too long解决办法

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楼主
遇到一个罕见的报错,在网上没有找到解决办法,现在已经解决了,在此记录一下供遇到相同问题的社友参考,报错内容如下:
Symbolic Z-matrix:
Charge = -2 Multiplicity = 1
N743                  3.94832   9.19387   17.08436
C744                  3.6378    8.17034   16.06667
C745                  4.42789   8.35071   14.762
O746                  4.8508    7.35884   14.17845
C747                  2.13573   8.00188   15.70941
C748                  1.15356   7.54113   16.78625
O749                  1.55075   7.24861   17.93442
O750                 -0.05326   7.47445   16.46554
The name of the center is too long.
N1050 -0.196977  5.834310  2.484449                                             
?
Error termination via Lnk1e in /home/gaussian/g16/l101.exe at Sat Dec  3 18:40:45 2022.

这个结构是从蛋白上挖出来的,提交gaussian运算的时候总是报The name of the center is too long的错误,后面测试发现是原子序号太大了,原子名称超过4位gaussian就无法处理,把输入文件里的原子序号去掉再提交就正常了

   -2    1
N743 3.948321  9.193873  17.084360
C744 3.637799  8.170339  16.066674
C745 4.427888  8.350714  14.761997
O746 4.850799  7.358837  14.178455
C747 2.135726  8.001875  15.709415
C748 1.153558  7.541134  16.786250
O749 1.550747  7.248606  17.934421
O750 -0.053256  7.474452  16.465544
N1050 -0.196977  5.834310  2.484449
C1051 -1.537018  6.334716  2.178737
C1052 -2.155946  7.360825  3.152555
O1053 -3.040068  8.106382  2.724450
C1054 -2.490314  5.124181  1.996236
……
改为
   -2    1
N 3.948321  9.193873  17.084360
C 3.637799  8.170339  16.066674
C 4.427888  8.350714  14.761997
O 4.850799  7.358837  14.178455
C 2.135726  8.001875  15.709415
C 1.153558  7.541134  16.786250
O 1.550747  7.248606  17.934421
O -0.053256  7.474452  16.465544
N -0.196977  5.834310  2.484449
C -1.537018  6.334716  2.178737
C -2.155946  7.360825  3.152555
O -3.040068  8.106382  2.724450
C -2.490314  5.124181  1.996236
……

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发表于 Post on 2022-12-4 01:26:47 | 只看该作者 Only view this author
本来诸如C1054就是非法命名
要么写元素名,要么写元素序号。乱写的话,就算程序计算没报错,也说不定根本就不是算出来你实际想算的东西
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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