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[综合交流] 求助分子力场拟合时improper项的处理

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楼主
请教关于力场拟合时improper项的几个问题:
1. 优化后的平衡结构中如果存在中心原子及与之相连接的3个原子是共平面结构,那improper项是不是通常都要考虑。比如(NH2)OH整体平衡结构是一个平面,NH2O这个improper项是否必须要考虑。
2. 拟合二面角时,需要QM扫描能量减去无二面角扭转项的MM能量,这种情况下的MM能量应该是包含improper项吧?
3. 对于improper项的拟合,如果以“out-of-plane bend”概念,需要改变某个边缘原子的连接键与其他三个原子平面的夹角,那这个边缘原子是任意选的吗,对整体结构的影响怎么考虑
4. imprope项GIC柔性扫面的话,通过余弦/正弦函数找键、键垂直高度、键投影之间的几何关系,然后自己通过余弦值/正弦值对应相应的夹角,不知道是否可行。

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发表于 Post on 2022-12-7 03:52:46 | 只看该作者 Only view this author
1 不是绝对要考虑。如果已有的二面角项已经足矣很好保持平面就不是必须得结合improper项

2 是

3、4 没必要拟合。improper项通常就是个谐振势维持平面或特定值,猜个数量级合适的力常数就够了。
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