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[ORCA] ORCA的溶剂模型;ORCA不同版本能否共存

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本帖最后由 火车头 于 2022-12-27 18:53 编辑

请教一下大佬们:1)我想用orca算穆斯堡尔谱,文献作了参数拟合,当时17年的文献使用orca3.0.3,cosmo溶剂模型。但是我现在安装了orca5.0.3里面用不了cosmo关键词,但是手册里写用CPCMC关键词可以使用COSMO epsilon function,不知道这和之前版本的COSMO关键词效果是不是一样的?或者说,能否在ORCA5.0.3上实现ORCA3.0.3的COSMO关键词完全一样的效果?
2)一个集群上能否同时安装运行两个版本的ORCA?在有ORCA5.0.3的基础上,我又补装了ORCA3.0.3(搭配openmpi165),但是这一版无法通过测试,卡住不算了。不知道是不是因为两个版本不能同时计算


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-27 18:57:44 | 只看该作者 Only view this author
更新:改成单核测试成功了,多核不行

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发表于 Post on 2022-12-28 03:26:41 | 只看该作者 Only view this author
你可以按ORCA手册里说的用CPCMC(solvent),和3.0.3的COSMO做个对比,如果差异不可忽略那就只能用3.0.3了
3.0.x和5.0.x对OpenMPI版本要求明显不同,没法俩同时使用
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-28 09:19:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-12-28 03:26
你可以按ORCA手册里说的用CPCMC(solvent),和3.0.3的COSMO做个对比,如果差异不可忽略那就只能用3.0.3了
3 ...

现在的问题就是,我装了3.0.3没法并行计算,但是我和文献对比感觉是差的挺远的;关于两个openmpi版本,我用pbs提交任务,环境变量在pbs里定义按理说是不是也是可以的?

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发表于 Post on 2022-12-29 03:02:46 | 只看该作者 Only view this author
火车头 发表于 2022-12-28 09:19
现在的问题就是,我装了3.0.3没法并行计算,但是我和文献对比感觉是差的挺远的;关于两个openmpi版本,我 ...

让3.0.3标配的OpenMPI版本处于激活状态
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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发表于 Post on 2022-12-29 05:58:01 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 beefly 于 2022-12-29 06:02 编辑

COSMO和CPCM、CPCMC对芯电子性质的影响差不多,不用刻意区分。需要注意的一点是,在3.0版本中,如果def2基组(如def2-TZVP)与相对论哈密顿ZORA、DKH(还有精度高于ZORA的IORA,但用的比较少)搭配,ORCA用的并不是def2-TZVP基组,而是在程序内部改成了ZORA/DKH-def2-TZVP。一些论文作者没注意这点,说自己用的是def2基组,但是用ORCA高版本重复不出结果,就说是CPCMC溶剂模型不好。其实,ZORA/DKH-def2与def2的芯电子性质差距很大,原始的def2结果比较差。在后来的ORCA版本中,程序不会擅自修改基组,用户必须明确指定def2或ZORA/DKH-def2,这样两个版本得到的芯电子性质就有可比性了。

我机器上的ORCA 3.0和5.0版本共用同一版本的OpenMPI,没遇到运行问题。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-29 10:00:04 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 火车头 于 2022-12-29 10:04 编辑
sobereva 发表于 2022-12-29 03:02
让3.0.3标配的OpenMPI版本处于激活状态

谢谢社长,已经解决!我记得上次自己在帖子下补充说明已经解决了,但好像没发出来。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-29 10:03:34 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 火车头 于 2022-12-29 10:09 编辑
beefly 发表于 2022-12-29 05:58
COSMO和CPCM、CPCMC对芯电子性质的影响差不多,不用刻意区分。需要注意的一点是,在3.0版本中,如果def2基 ...

大佬一语中的,用的正是def2-TZVP基组搭配ZORA,ORCA5.0.3算出来的结果和3.0.3差的很多,原来是这个原因!我的两个版本也成功运行了(使用各自版本的openmpi,用pbs脚本定义环境变量,提交到不同节点上,同一节点还没试过),现在没有问题。

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