求助：重组能是否有第三种计算方法

sobereva · 发表于 Post on 2023-2-15 05:56:02

hequ 发表于 2023-2-13 16:11
老师，再请教您一下，您说的根据内坐标的变化代进谐振势，请问是与您在这篇帖子http://sobereva.com/330 ...

我文中没说内坐标的事

势函数对坐标的展开如下（M、N、P姑且当做原子序号）：

用谐振近似时，对当前问题，只需要考虑其第3项，可见既有坐标的对角贡献，也有坐标间的耦合贡献。Gaussian可以给出冗余内坐标的Hessian矩阵，结合你的局部片段的冗余内坐标变化，代进式子就能计算。需要自己写个程序

hequ · 发表于 Post on 2023-2-16 15:04:26

sobereva 发表于 2023-2-15 05:56
我文中没说内坐标的事

势函数对坐标的展开如下（M、N、P姑且当做原子序号）：

明白了，感谢老师的解答

量化新人 · 发表于 Post on 2023-3-27 15:20:39

sobereva 发表于 2023-2-12 23:31
我说的第四法不是对A和B都算四个点，而是对A和B各算两个点，总共四个点。具体来说，对于(A-) + B → A ...

老师您好，学习帖子和博文发现，有一点疑惑，这样算出来的重组能是内重组能吗？要是再隐式溶剂下计算(A-) + B → A + (B-)的过程的重组能是不是要按照这个帖子里的方法http://sobereva.com/333，和现在讲的E(A [A-]) - E(A [A]) + E(B- [B]) - E(B- [B-])就不同了，还是说也是E(A [A-]) - E(A [A]) + E(B- [B]) - E(B- [B-])这样计算，只是算的方法用帖子里的方法？

btm · 发表于 Post on 2023-4-19 17:26:38

sobereva 发表于 2023-2-12 05:15
比如(A-) + B → A + (B-)的电子转移过程，将IUPAC的定义用于Marcus理论时候，考虑的是(A-) + B 和 A + ...

老师，您认为四点法里“反应物平衡结构下产物态的自由能该怎么求”单纯改变电荷和自旋多重度会有许多虚频。能用“反应物平衡结构下的产物电子能量”+：“反应物平衡结构的Thermal correction to Gibbs Free Energy”吗？

btm · 发表于 Post on 2023-4-19 18:49:37

wzkchem5 发表于 2023-2-12 19:23
但是四点法对A和B分别算、再加和，并不等价于“A + (B-)态的能量在 (A-) + B的极小点和 A + (B-) 极小点 ...

老师，那这个E(A[A-])的自由能该如何求，如果只改变电荷会有很多虚频，能使用E(A[A-])+“A的Thermal correction to Gibbs Free Energy”吗？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-4-19 20:04:52

btm 发表于 2023-4-19 11:49
老师，那这个E(A[A-])的自由能该如何求，如果只改变电荷会有很多虚频，能使用E(A[A-])+“A的Thermal corr ...

正因为如此，所以要用电子能而非自由能

Lipy · 发表于 Post on 2023-11-20 12:43:58

sobereva 发表于 2023-2-12 05:15
比如(A-) + B → A + (B-)的电子转移过程，将IUPAC的定义用于Marcus理论时候，考虑的是(A-) + B 和 A + ...

C:\Users\dell\Desktop\1.png

请问社长，您的意思是对于(A-)+B=A+(B-)，假定Neutral是(A-)+B透热态，Charged是A+(B-)透热态，用Marcus理论计算时，重组能只考虑图中的λ(ll)吗？

Lipy · 发表于 Post on 2023-11-20 13:21:13

sobereva 发表于 2023-2-12 05:15
比如(A-) + B → A + (B-)的电子转移过程，将IUPAC的定义用于Marcus理论时候，考虑的是(A-) + B 和 A + ...

在使用Marcus理论时，对于(A-)+B=A+(B-)过程，使用CDFT方法分别优化(A-)+B和A+(B-)两个透热态的几何结构极小值点，然后分别计算A+(B-)透热态在这两个几何结构极小值点的能量，他们的差值就是重组能吗？

sobereva · 发表于 Post on 2023-11-21 02:07:18

Lipy 发表于 2023-11-20 12:43
请问社长，您的意思是对于(A-)+B=A+(B-)，假定Neutral是(A-)+B透热态，Charged是A+(B-)透热态，用M ...

是

sobereva · 发表于 Post on 2023-11-21 02:10:57

Lipy 发表于 2023-11-20 13:21
在使用Marcus理论时，对于(A-)+B=A+(B-)过程，使用CDFT方法分别优化(A-)+B和A+(B-)两个透热态的几何结构 ...

是

fcb0310 · 发表于 Post on 2023-12-21 20:02:51

sobereva 发表于 2023-2-12 23:31
我说的第四法不是对A和B都算四个点，而是对A和B各算两个点，总共四个点。具体来说，对于(A-) + B → A ...

sob老师，您好。我最近也在对分子间的电子转移进行计算。我想问您说的这种分子间电子转移的计算方法，有没有参考文献或者应用您这种方法的已发表文献。

fcb0310 · 发表于 Post on 2023-12-21 21:02:20

sobereva 发表于 2023-2-12 23:31
我说的第四法不是对A和B都算四个点，而是对A和B各算两个点，总共四个点。具体来说，对于(A-) + B → A ...

老师，您好。我最近也在做分子间电子转移的计算。使用的是您所说的计算方法，请问是否有需要额外引用的相关文献呢？

xxtnenu · 发表于 Post on 2024-10-10 06:47:42

sobereva 发表于 2023-2-12 23:31
我说的第四法不是对A和B都算四个点，而是对A和B各算两个点，总共四个点。具体来说，对于(A-) + B → A ...

请问sob老师，此处对于A：E(A [A-]) - E(A [A])，对于B：E(B- [B]) - E(B- [B-])，为何不是|E(A [A-]) - E(A [A])|和|E(B- [B]) - E(B- [B-])|，A-极小点结构的能量一定高于A极小点的能量吗？

sxkl · 发表于 Post on 2024-11-10 21:51:09

wzkchem5 发表于 2023-2-13 00:21
嗯，我同意这个计算方法，但是博文http://sobereva.com/330说的计算方法好像和这个算法不等价。按我理解 ...

请问在只知道原子坐标（高斯输入文件gjf）或者HOMO、LUMO的情况下能否直接判断该物质是属于空穴型还是电子型，因为四点法计算需要知道物质的价电情况

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-11-11 09:57:39

sxkl 发表于 2024-11-10 14:51
请问在只知道原子坐标（高斯输入文件gjf）或者HOMO、LUMO的情况下能否直接判断该物质是属于空穴型还是电 ...

不能脱离实际应用领域讲一个物质是空穴型还是电子型，一方面周围环境是氧化环境或还原环境下判断结论可能不同，另一方面有的物质可能两种特性兼备。在特定领域（例如有机电子学）里可能是有通用判据的，但是不适用于其他领域

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[综合交流] 求助：重组能是否有第三种计算方法