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[综合讨论] 如何计算水中某多元弱酸的带电荷量?

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楼主
如题。
想用模拟来验证一种多元弱酸(支链上有十几个羧基)在水中的动力学行为,但是不知道这个弱酸的具体带电量,想问问各位老师,是否可以用量化或第一性原理的方法,来计算这种弱酸在大量水中的带电量?

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发表于 Post on 2023-2-22 04:21:08 | 只看该作者 Only view this author
CP2K跑足够长时间的AIMD,对轨迹统计羧基带质子的数目,得到平均值
如果羧基之间没有显著耦合,也可以用量化程序分别计算pKa然后根据分析化学里的知识估计
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-22 13:39:06 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 社会主义小战士 于 2023-2-22 19:26 编辑
sobereva 发表于 2023-2-22 04:21
CP2K跑足够长时间的AIMD,对轨迹统计羧基带质子的数目,得到平均值
如果羧基之间没有显著耦合,也可以用量 ...

感谢社长的回复。想用CP2K来计算,但是之前没学过,想问下针对这个计算有没有可以参考的文献或者教程呢?

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发表于 Post on 2023-2-22 20:45:49 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 chands 于 2023-2-22 21:00 编辑
社会主义小战士 发表于 2023-2-22 13:39
感谢社长的回复。想用CP2K来计算,但是之前没学过,想问下针对这个计算有没有可以参考的文献或者教程呢? ...

社长的Multiwfn有生成CP2K输入文件的功能。
CP2K官方手册 https://manual.cp2k.org/,附少数例子。官方手册写得乱糟糟,习惯了就好。
问问题除了本论坛外还有CP2K google forum(KX上网)。

想上课的话论坛顶部有大红字呢。
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
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发表于 Post on 2023-2-23 04:01:23 | 只看该作者 Only view this author
社会主义小战士 发表于 2023-2-22 13:39
感谢社长的回复。想用CP2K来计算,但是之前没学过,想问下针对这个计算有没有可以参考的文献或者教程呢? ...

没有现成的教程,CP2K那么复杂的程序的使用更不是论坛上几句话能说清楚的事
北京科音CP2K培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)里详细讲怎么用CP2K跑AIMD
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-23 08:14:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-2-23 04:01
没有现成的教程,CP2K那么复杂的程序的使用更不是论坛上几句话能说清楚的事
北京科音CP2K培训班(http:/ ...

那太好了,我去问问导师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-23 08:15:36 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2023-2-22 20:45
社长的Multiwfn有生成CP2K输入文件的功能。
CP2K官方手册 https://manual.cp2k.org/,附少数例子。官方 ...

多谢!

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