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[综合讨论] 请教下关于过渡态计算中初末态结构如何确定的问题

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楼主
      老师们、同学们好,最近想要做一个CO与晶格氧反应的过渡态计算,但是对于初态结构应该如何构建感到有些困惑。我找到了一篇文献做了同样类型的过渡态计算,发现在这篇文献里初态CO是吸附在金属slab上的,CO氧化的过程大致是CO吸附(初态)→与晶格氧反应(末态)→CO2脱附(末态2),在这篇文章中是用CP2K使用AIMD的方法确定了这个反应的初末态。
      我对此产生的疑问是,在初态结构的构建中如何确定CO具体应该吸附在金属slab的哪个位置呢?以及反应末态的结构应该如何确定呢?是否也是需要像这篇文献中一样使用AIMD的方法呢?
      感谢各位的阅读,望您不吝赐教,谢谢!

金负载的氧化铈催化氧化CO的理论计算.pdf

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发表于 Post on 2023-2-22 04:28:37 | 只看该作者 Only view this author
AIMD不是唯一办法
如果有足够的研究经验,也可以自己摆各种可能合适的初猜结构去优化。跑AIMD适合对于可能发生的反应途径、吸附方式等完全难以估计的时候去做

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白皛白 + 5 谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-22 10:02:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-2-22 04:28
AIMD不是唯一办法
如果有足够的研究经验,也可以自己摆各种可能合适的初猜结构去优化。跑AIMD适合对于可能 ...

非常感谢sob老师的指点,我做的结构和反应相较于这篇文章中的简单很多,目前计划自己摆一个初猜去先计算一下试一试。

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发表于 Post on 2023-4-21 18:59:26 | 只看该作者 Only view this author
白皛白 发表于 2023-2-22 10:02
非常感谢sob老师的指点,我做的结构和反应相较于这篇文章中的简单很多,目前计划自己摆一个初猜去先计算 ...

我的理解是首先根据实验机理,再对照别人做的同类型的,再对比着猜猜自己做的初始态和末态
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