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[ORCA] ORCA结构优化后配位键没有连接

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请教一下大家,我的初始结构是单晶结构导出的,没有改变单双键,正常优化完后,输出的结构变化特别大,而且反常,配位键也没有连接,问问大家这是为什么,应该怎样用单晶cif构建初始计算结构,谢谢大家

SF6P1NG`U~(1B}41O9HBFKQ.png (114.04 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

SF6P1NG`U~(1B}41O9HBFKQ.png

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天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

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发表于 Post on 2023-2-24 17:18:15 | 只看该作者 Only view this author
你这种结构肯定是一堆构象,优化掉进某个极小点也是正常。
另外我猜你是直接优化气相中某个晶胞的结构,这本来就跟晶体(固态)中的晶胞结构不一样。
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

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发表于 Post on 2023-2-24 17:32:30 | 只看该作者 Only view this author
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-24 18:12:44 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2023-2-24 17:18
你这种结构肯定是一堆构象,优化掉进某个极小点也是正常。
另外我猜你是直接优化气相中某个晶胞的结构,这 ...

老师,应该怎样设置计算和晶体固相一致

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-24 18:14:19 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-2-24 17:32
仔细阅读http://sobereva.com/414、http://sobereva.com/569

谢谢老师分享,刚入门,我认真阅读一下

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发表于 Post on 2023-2-24 21:38:50 | 只看该作者 Only view this author
对于稍微有点配位化学直觉的人来说,上面提到的的问题其实都不是大问题。我看你这个结构,第一个想到的问题是,你的电荷和自旋多重度可能设置有问题。建议重新检查一下设置。我不知道你用的泛函是什么,虽然B3LYP可能不是最适合这种体系的,但是不至于优化成这个样子吧。你给出的信息太少,还没办法准确确定问题的根源,需要提供更多有效信息,至少gjf文件上传上来看看。

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