求助：编译cp2k出现make: ***[makefile: 120: all] error 2

longqiyang · 发表于 Post on 2023-3-3 12:03:02

本帖最后由 longqiyang 于 2023-3-3 12:05 编辑

各位老师，我输入source /sob/cp2k-8.1/tools/toolchain/install/setup
cd /sob/cp2k-8.1
make -j 4 ARCH=local VERSION="ssmp psmp"这个命令后开始编译，然后出现图中的错误；我运行dnf install zlib-devel命令装上zlib库，提示这个库已经存在，再运行make指令，还是存在这个错误，exe/local文件夹下的文件没有cp2k.popt、cp2k.psmp，该怎么处理，多谢

zjxitcc · 发表于 Post on 2023-3-3 12:19:29

本帖最后由 zjxitcc 于 2023-3-3 12:37 编辑

你图中所示报错不是第一次报错的地方，也没明确写明是cannot find -lz问题，最好展示第一次报错之处。

先假定你确实碰到了这个问题，那可以参考我写的《离线安装CP2K-2022.2(Intel编译器)》，其中6.2 ld: cannot find -lz小节有提到，检查一下你的libz库名称，可能你的libz库名称是libz.so.1.2.7之类的，就是没有libz.so，那么要创建软链接并写上库路径。

longqiyang · 发表于 Post on 2023-3-3 12:39:11

zjxitcc 发表于 2023-3-3 12:19
你图中所示报错不是第一次报错的地方，也没明确写明是cannot find -lz问题，最好展示第一次报错之处。

...

老师，有这个文件，libz.so

zjxitcc · 发表于 Post on 2023-3-3 12:45:34

longqiyang 发表于 2023-3-3 12:39
老师，有这个文件，libz.so

那你可以试试6.2小节里面修改arch/local.psmp文件，添加库路径

longqiyang · 发表于 Post on 2023-3-3 13:08:54

zjxitcc 发表于 2023-3-3 12:45
那你可以试试6.2小节里面修改arch/local.psmp文件，添加库路径

嗯嗯好的老师，我试一下，感谢老师~

longqiyang · 发表于 Post on 2023-3-3 13:38:48

本帖最后由 longqiyang 于 2023-3-3 13:40 编辑

zjxitcc 发表于 2023-3-3 12:45
那你可以试试6.2小节里面修改arch/local.psmp文件，添加库路径

老师，我按照您的方法重新试了下，还是不成功，您帮忙看下我操作有没有问题；然后我打开cp2k-20222.1/arch/local.psmp里面最后一行并没有lz，图片里的[backcolor=rgba(27, 31, 35, 0.05)]-L$(HOME)/.local/lib -lz是我加上去的；

zjxitcc · 发表于 Post on 2023-3-3 13:44:20

本帖最后由 zjxitcc 于 2023-3-3 13:50 编辑

longqiyang 发表于 2023-3-3 13:38
老师，我按照您的方法重新试了下，还是不成功，您帮忙看下我操作有没有问题；然后我打开cp2k-20222.1/arc ...

你机器上既然已有libz.so，就不用创建软链接了，直接修改arch/local.psmp文件即可。你注意看你的-lz在LIBS = xxxx里面，对于你的文件来说，它在倒数两、三行（我电脑上它在最后一行，不太一样）。修改LIBS里面的，不要修改FYPPFLAGS那行。

longqiyang · 发表于 Post on 2023-3-3 15:03:41

zjxitcc 发表于 2023-3-3 13:44
你机器上既然已有libz.so，就不用创建软链接了，直接修改arch/local.psmp文件即可。你注意看你的-lz在LIB ...

老师，还是不行，我往上翻了下，发现我的报错并不是connot find -lz，而是connot find -lspla

，这种情况怎么处理呀

zjxitcc · 发表于 Post on 2023-3-3 15:30:46

本帖最后由 zjxitcc 于 2023-3-3 15:31 编辑

longqiyang 发表于 2023-3-3 15:03
老师，还是不行，我往上翻了下，发现我的报错并不是connot find -lz，而是connot find -lspla，这种情况 ...

我在2L一开始就提醒你确认是否libz问题。现在3-7L的内容白折腾了。。。
SPLA库是SIRIUS库所需，如果你不需要SIRIUS库的话，可以删除CP2K安装包，重来，在./install_cp2k_toolchain.sh那一步加上--with-sirius=no --with-spla=no

longqiyang · 发表于 Post on 2023-3-3 15:44:55

zjxitcc 发表于 2023-3-3 15:30
我在2L一开始就提醒你确认是否libz问题。现在3-7L的内容白折腾了。。。
SPLA库是SIRIUS库所需，如果你不 ...

对不起，老师，我之前确实没加--with-sirius=no，然后安装sirius这一步的时候，整个虚拟机卡住了，我直接叉掉了，然后重启，然后输入./install_cp2k_toolchain.sh --with-sirius=no --with-openmpi=install --with-plumed=install指令，再就是卡在了connot find -lspla这里；感谢老师耐心地指导，多谢多谢，我再重新试一下

jifeng131381 · 发表于 Post on 4 day ago

每次编cp2k都要找这个帖子 -./install_cp2k_toolchain.sh --with-openmpi=system --with-plumed=install -with-sirius=no --with-spla=no -j 48

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