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[GROMACS] 求助 gromacs能否可以一边模拟一边输出结果

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gromacs有可以实现一次模拟10ns,然后每隔2ns生成一次gro、xtc等文件的指令或是mdp的指令吗

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发表于 Post on 2023-3-10 19:42:59 | 只看该作者 Only view this author
gro好像只有最后可以输出吧,不过xtc可以在mdp里面设置。

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发表于 Post on 2023-3-11 16:14:46 | 只看该作者 Only view this author
gro没法每隔特定时间产生,但是你可以之后用trjconv从xtc/trr里把对应特定时刻间隔的结构切出来成为gro文件
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