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楼主 Author: BBH
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[CASTEP/Dmol3/MS] 求助计算ITO吸附能时SCF不收敛

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发表于 Post on 2023-3-14 20:48:46 | 只看该作者 Only view this author
BBH 发表于 2023-3-14 18:04
老师,您好,我这里出现了新的问题,资料已补充至一楼,能否劳烦您帮我看一眼该如何处理

感觉是在超算使用上存在一些问题,这个就没法儿具体地判定哪个环节出错了。而且你给的输入输出文件都是同一份输入文件。
心之所向,日复一日,必有精进

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-14 23:01:15 | 只看该作者 Only view this author
含光君 发表于 2023-3-14 20:48
感觉是在超算使用上存在一些问题,这个就没法儿具体地判定哪个环节出错了。而且你给的输入输出文件都是同 ...

老师,我之前发现了输入输出文件的问题,后面已经修改过了,如果您有时间,还劳烦您再看一次

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发表于 Post on 2023-3-16 16:58:34 | 只看该作者 Only view this author
BBH 发表于 2023-3-14 18:04
老师,您好,我这里出现了新的问题,资料已补充至一楼,能否劳烦您帮我看一眼该如何处理

抱歉这两天忙着干实验qwq
最后的这个新问题不像是计算本身问题,可能是超算问题,这个我没经验(一直都是自装机跑计算)
有个疑问是,你似乎一直执着于提高截断能呢?可以考虑k点的调整,有时用Gamma点会让受力计算粗糙、力震荡而不收敛(个人经验)
居高声自远,非是藉秋风

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-16 20:26:17 | 只看该作者 Only view this author
DesignChemistry 发表于 2023-3-16 16:58
抱歉这两天忙着干实验qwq
最后的这个新问题不像是计算本身问题,可能是超算问题,这个我没经验(一直都 ...

好的,谢谢老师,提高截断能是因为我去问组里面一个也用MS的师兄,师兄说提高截断能试一下,他之前就是靠提高截断能成功的。

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发表于 Post on 2023-3-16 20:51:59 | 只看该作者 Only view this author
BBH 发表于 2023-3-16 20:26
好的,谢谢老师,提高截断能是因为我去问组里面一个也用MS的师兄,师兄说提高截断能试一下,他之前就是靠 ...

在我做过类似的主族金属氧化物体系(如In2O3)中,结构优化用收敛性测试得到的值就够用了,基本只微小地影响数值,没遇到过影响SCF和几何优化收敛的,升高并不会有明显增益。
居高声自远,非是藉秋风

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发表于 Post on 2023-3-16 23:10:57 | 只看该作者 Only view this author
初始结构中,为什么不让SO2躺下?上几天用cp2k算二水合铊,发现如果站着,容易跑散,也不容易收敛;让它们躺下则容易地多

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-20 16:43:14 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 BBH 于 2023-3-20 16:50 编辑
DesignChemistry 发表于 2023-3-16 20:51
在我做过类似的主族金属氧化物体系(如In2O3)中,结构优化用收敛性测试得到的值就够用了,基本只微小地 ...

好的,谢谢老师,最近在忙别的事情,就没有怎么登这个网站,不好意思这个时候才看到消息,同时我也想问一下老师一个问题,就是老师在对In2O3进行的几何优化过程中,有选择自旋或者LDA+U吗,因为我看的一些参考文献里面有用LDA+U去对SnO2进行几何优化,但是Sn和In一样都是主族元素,师兄告诉我对于主族元素不需要用这些去加长计算时间,想问一下,老师是怎么选择的

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-20 16:43:44 | 只看该作者 Only view this author
reid 发表于 2023-3-16 23:10
初始结构中,为什么不让SO2躺下?上几天用cp2k算二水合铊,发现如果站着,容易跑散,也不容易收敛;让它们 ...

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2023-3-21 16:15:15 | 只看该作者 Only view this author
BBH 发表于 2023-3-20 16:43
好的,谢谢老师,最近在忙别的事情,就没有怎么登这个网站,不好意思这个时候才看到消息,同时我也想问一 ...

自旋没必要开;+U与否 看你后边需不需要进行电子结构的分析,以及多找些文献看看LDA/GGA级别描述的偏差有多大。我当时的体系只算个吸附能和自由能台阶图,就没有加;如果后边需要DOS、能带之类的分析,应该从几何优化就开始加
居高声自远,非是藉秋风

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-25 17:38:20 | 只看该作者 Only view this author
DesignChemistry 发表于 2023-3-21 16:15
自旋没必要开;+U与否 看你后边需不需要进行电子结构的分析,以及多找些文献看看LDA/GGA级别描述的偏差有 ...

好的,谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-26 10:13:22 | 只看该作者 Only view this author
DesignChemistry 发表于 2023-3-21 16:15
自旋没必要开;+U与否 看你后边需不需要进行电子结构的分析,以及多找些文献看看LDA/GGA级别描述的偏差有 ...

老师,您好,我还有一个问题想请教一下,就是ITO吸附一般是在较高温度下进行的,在用castep计算吸附能时,可以从哪里修改温度吗,我在网上搜索没有搜索到

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发表于 Post on 2023-3-26 22:11:57 | 只看该作者 Only view this author
BBH 发表于 2023-3-26 10:13
老师,您好,我还有一个问题想请教一下,就是ITO吸附一般是在较高温度下进行的,在用castep计算吸附能时 ...

不考虑温度影响的话,算出来的电子能量(E)直接减就行了,算电子能量无法考虑温度
需要考察温度影响的话,建议AIMD
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-27 19:30:38 | 只看该作者 Only view this author
DesignChemistry 发表于 2023-3-26 22:11
不考虑温度影响的话,算出来的电子能量(E)直接减就行了,算电子能量无法考虑温度
需要考察温度影响的 ...

好的,谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-23 14:32:04 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 BBH 于 2023-4-23 17:10 编辑
DesignChemistry 发表于 2023-3-16 20:51
在我做过类似的主族金属氧化物体系(如In2O3)中,结构优化用收敛性测试得到的值就够用了,基本只微小地 ...

老师,您好,我最近又遇到了一些问题想请教一下您,我再算ITO吸附能计算,首先构建的晶面是In2O3的(100)面,选取的是In终止面,为了不破化化学计量比,所以在切面时top值为0.033,thickness值为1,并且对In原子和O原子均加了U值,分别为3eV和5eV,切出来的面包含8层原子,为极性表面,所以我进行了偶极修正(只是在calculation里勾选了self-consistent),固定了下面的四层原子,真空层厚度为20A,但是在优化前后原子的整体位置进行了移动,想问一下我这种情况正确吗,计算时core选择了32,跑了一天了也之跑出一个点,也能否麻烦您帮我看一下我的参数设置是否正确,同时也想问一下,对于这种极性表面,若不加偶极修正,对计算吸附能、能带结构、PDOS以及mulliken有影响吗?麻烦老师了。
(材料我补充在了一楼)

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