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楼主 Author: dingliping1108
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[ORCA] 溶解自由能修正问题

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发表于 Post on 2016-10-6 08:57:20 | 只看该作者 Only view this author
恩恩,好的,多谢sob老师,不胜感激!!

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发表于 Post on 2019-2-23 08:05:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-21 18:40
为了清晰,我再说一下计算流程,以A + B -> A-B为例

1 用m062X/def2-SVP优化A···B复合物结构,并做振 ...

老师,请问做单点计算的结构为什么是用在气相下的结构呢,因为我的反应是在溶剂中反应的,所以我可以先在溶剂模型下优化找到复合物和过渡态的结构,再用此结构在气相下计算单点和气相下的自由能么?

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发表于 Post on 2019-2-23 22:52:01 | 只看该作者 Only view this author
九曜 发表于 2019-2-23 08:05
老师,请问做单点计算的结构为什么是用在气相下的结构呢,因为我的反应是在溶剂中反应的,所以我可以先在 ...

溶剂对溶质分子结构影响往往不大,多数情况溶剂下优化和气相下优化没有显著区别(也有很多例外)。如果为了严格,优化建议也在溶剂环境下优化
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2019-2-24 07:04:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-2-23 22:52
溶剂对溶质分子结构影响往往不大,多数情况溶剂下优化和气相下优化没有显著区别(也有很多例外)。如果为 ...

感谢老师

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truffle

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发表于 Post on 2020-12-3 19:40:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-21 18:40
为了清晰,我再说一下计算流程,以A + B -> A-B为例

1 用m062X/def2-SVP优化A···B复合物结构,并做振 ...

Sob老师您好,我想向您请教一下,这里可以用A···B复合物以及过渡态在溶液下的自由能差计算得到的势垒来计算反应速率常数k吗?我看您到的博文说要分别优化A和B的结构再分别计算自由能相加。
No problem is insoluble in all conceivable circumstances.

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发表于 Post on 2020-12-4 08:54:13 | 只看该作者 Only view this author
naoki 发表于 2020-12-3 19:40
Sob老师您好,我想向您请教一下,这里可以用A···B复合物以及过渡态在溶液下的自由能差计算得到的势垒 ...

当且仅当在实验的浓度下,A和B复合生成A…B复合物的平衡有利于右侧的时候,应该这样做。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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truffle

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发表于 Post on 2020-12-4 17:53:25 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-12-4 08:54
当且仅当在实验的浓度下,A和B复合生成A…B复合物的平衡有利于右侧的时候,应该这样做。

好的,谢谢王老师。
No problem is insoluble in all conceivable circumstances.

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