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楼主 Author: Caroline2022
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[ORCA] 由于安装更新版本ORCA而导致的OpenMPI冲突应该如何处理?

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发表于 Post on 2023-3-17 20:10:49 | 只看该作者 Only view this author
或者
试试这种方案
http://bbs.keinsci.com/thread-26418-1-1.html

或者编译openMPI的时候,- -prefix = App1 每次更换App中的数字,
就可以了。


【以普通用户源码编译安装 gcc9 套件-哔哩哔哩】 https://b23.tv/OQSFZU1
可以观摩这里,写prefix 路径,可以很灵活的。
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发表于 Post on 2023-3-17 20:32:14 | 只看该作者 Only view this author
Caroline2022 发表于 2023-3-17 11:48
我检查了一遍,感觉不应该是手抖或者误操作。在两个不同的文件夹下编译安装了两次,都还是一样的错误提示 ...

那再搜一下openmpi编译时遇到的loT文件是干什么用的
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-18 11:46:33 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2023-3-17 20:10
或者
试试这种方案
http://bbs.keinsci.com/thread-26418-1-1.html

老师,我前几天也看到您这个帖子,还没来得及仔细研究和尝试。不知道这样安装的ORCA可以被Molclus调用么?我是仿照SOb老师的这篇帖子http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html中的方法寻找高分子材料的不同构型时需要安装ORCA。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-18 11:47:11 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-3-17 20:32
那再搜一下openmpi编译时遇到的loT文件是干什么用的

谢谢您,我周一再找朋友帮我Google一下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-20 09:50:47 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-3-17 20:32
那再搜一下openmpi编译时遇到的loT文件是干什么用的

老师,再请教您一个问题:我目前的情况是只完成了编译,然后安装时遇到错误所以终止了,那么我现在如果想尝试重新编译和安装的话,可以直接把这个文件夹(即/sob/openmpi-4.1.1或/sy/openmpi-4.1.1/lib文件夹)删除掉么?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-20 14:08:21 | 只看该作者 Only view this author
在OpenMPI官网FAQ中看到的一段关于新旧版本替换的文字:

    Install newer versions of Open MPI into a different directory. For example, install into /opt/openmpi-a.b.c and /opt/openmpi-x.y.z for versions a.b.c and x.y.z, respectively.
    Completely uninstall the old version of Open MPI before installing the new version. The make uninstall process from Open MPI a.b.c build tree should completely uninstall that version from the installation tree, making it safe to install a new version (e.g., version x.y.z) into the same installation tree.
    Remove the old installation directory entirely and then install the new version. For example "rm -rf /opt/openmpi" *(assuming that there is nothing else of value in this tree!)* The installation of Open MPI x.y.z will safely re-create the /opt/openmpi tree. This method is preferable if you no longer have the source and build trees to Open MPI a.b.c available from which to "make uninstall".
    Go into the Open MPI a.b.c installation directory and manually remove all old Open MPI files. Then install Open MPI x.y.z into the same installation directory. This can be a somewhat painful, annoying, and error-prone process. We do not recommend it. Indeed, if you no longer have access to the original Open MPI a.b.c source and build trees, it may be far simpler to download Open MPI version a.b.c again from the Open MPI web site, configure it with the same installation prefix, and then run "make uninstall". Or use one of the other methods, above.
我在原来装错的openmpi313目录下打开终端,输入make uninstall命令后,显示的是:make: *** No rule to make target `uninstall'.  Stop.

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发表于 Post on 2023-3-20 17:02:40 | 只看该作者 Only view this author
Caroline2022 发表于 2023-3-20 02:50
老师,再请教您一个问题:我目前的情况是只完成了编译,然后安装时遇到错误所以终止了,那么我现在如果想 ...

可以
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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发表于 Post on 2023-3-20 17:03:55 | 只看该作者 Only view this author
Caroline2022 发表于 2023-3-20 07:08
在OpenMPI官网FAQ中看到的一段关于新旧版本替换的文字:

    Install newer versions of Open MPI into  ...

检查一下这个FAQ是不是只适用于某个版本以后的openmpi,而不适用于3.1.3
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-20 18:55:50 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Caroline2022 于 2023-3-20 19:05 编辑
wzkchem5 发表于 2023-3-20 17:03
检查一下这个FAQ是不是只适用于某个版本以后的openmpi,而不适用于3.1.3

老师,我的问题解决了,今天下午又将Sob老师的方法仔细读了一遍,发现一个可能遗漏的点,把make all install后面的-j去掉后就顺利安装完成了,还是自己不够仔细,原来Sob老师已经把可能出现的情况都给大家想到了。

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