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[综合交流] 求助:关于VaReCoF软件的Manual和Examples无法下载的问题

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本人想要采用VaReCoF软件结合MESS软件计算无能垒反应速率,从这个网址可以下载到VaReCof的源代码(Home of the PAPR suite of chemical kinetics codes (anl.gov)),可是网站中的Manual和Examples无法下载,只要一点击Manual和Examples,就会跳转至另外一个页面(如图所示),并未激活下载功能,不知道是不是网站屏蔽下载了,我已经更换过各种浏览器,均无法正常下载。请问论坛内是否有老师曾经下载过VaReCoF的Manual和Examples,可否分享一下,十分感谢。

微信截图_20230317121619.png (497 KB, 下载次数 Times of downloads: 45)

网站无法下载页面

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发表于 Post on 2023-3-20 01:41:22 | 只看该作者 Only view this author
网页链接有错,联系项目方更改吧。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-20 14:38:33 | 只看该作者 Only view this author
嗯嗯,应该是网站出错了,正在联系他们。

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发表于 Post on 2023-3-20 14:49:32 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Mikasa 于 2023-3-20 14:55 编辑

https://doi.org/10.1073/pnas.1920018117
https://doi.org/10.1073/pnas.1616208113
https://comp.chem.umn.edu/polyrate/
Polyrate的VRC功能用起来也很方便





流年似水,浮生如梦。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-20 15:29:24 | 只看该作者 Only view this author
Mikasa 发表于 2023-3-20 14:49
https://doi.org/10.1073/pnas.1920018117
https://doi.org/10.1073/pnas.1616208113
https://comp.chem. ...

十分感谢您的回复,我用过polyrate计算过VRC-TST,但是有以下疑问:
polyrate的VRC-TST计算出来的结果针对的是单步无能垒反应的反应速率,如果我要计算多步反应的总体反应速率(比如第一步是无能垒反应,后面都是有过渡态的反应),polyrate似乎无法实现。于是我打算采用MESS去实现这个功能,而MESS调用VRC-TST,需要的是反应能流(the reactive flux,不知道翻译是否准确),文献表明VaReCof可以计算输出,polyrate也能像VaReCof一样输出反应能流嘛?

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6#
发表于 Post on 2023-5-21 22:39:54 | 只看该作者 Only view this author
请问楼主有找到VaReCof的编译安装和使用的教程吗 我在网上找不到多余的资料

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7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-8 12:34:40 | 只看该作者 Only view this author
moyang 发表于 2023-5-21 22:39
请问楼主有找到VaReCof的编译安装和使用的教程吗 我在网上找不到多余的资料

guthub上面有的,但是我不知道那个能不能用,我没有成功安装过

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8#
发表于 Post on 2023-10-17 14:53:07 | 只看该作者 Only view this author
在github上找到了这个程序以及Manual(好像不是很全):
https://github.com/haoxy97/VaReCoF
没有做测试,大家用过可以多交流。

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9#
发表于 Post on 2023-11-30 10:02:09 | 只看该作者 Only view this author
请问运行VaReCoF的命令是啥啊?有用过的吗?

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10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-16 15:56:44 | 只看该作者 Only view this author
flybird52888 发表于 2023-11-30 10:02
请问运行VaReCoF的命令是啥啊?有用过的吗?

我连安装都没有安装成功更不知道怎么运行了

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