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[GROMACS] 如何使用tip4p/ice水模型构建冰水混合物

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楼主
跟着大佬提供的知乎文章,构建了tip4p/ice冰水混合物,水结冰模拟及TIP4P/ICE水模型使用 - 知乎 (zhihu.com),但是有些问题还想请问一下各位大佬,
1.使用tip4p/ice水模型构建冰水混合物的时候一定要使用三点水模型转四点水模型吗,有没有其他的办法可以直接构建呢?可以直接用genice构建这个水模型下的冰吗(但是我看genice里提供的水模型没有tip4p/ice)?
2.可以在这个建好的冰水模型中添加离子或者化合物等物质,来观察凝固点的下降或者凝固的快慢吗?


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Nerv

2#
发表于 Post on 2023-3-25 14:13:43 | 只看该作者 Only view this author
1.genice可直接构建tip4p的冰结构。先搞清楚水模型和力场的差别,tip4p家族对应的都是四点水模型,力场你自己随意选择就可以了。
2.可以,但化合物和离子一般加入到水中,也就是说你要模拟冰水混合体系
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-25 20:36:23 | 只看该作者 Only view this author
Lacrimosa 发表于 2023-3-25 14:13
1.genice可直接构建tip4p的冰结构。先搞清楚水模型和力场的差别,tip4p家族对应的都是四点水模型,力场你自 ...

好的,谢谢大佬

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