计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1362|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[波函数分析求助] 求助:VMD可视化范德华势时isovalue的单位是什么?

[复制链接 Copy URL]

1

帖子

0

威望

81

eV
积分
82

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位老师,我在用VMD可视化范德华势结果的时候,为了便于观察把isovalue设置成了-1.2,现在写文章需要提到isovalue的值,我想请问一下isovalue的单位是kcal/mol吗?是不是可以理解成当探针原子在这个等值面上时,主体分子与探针原子之间的结合能为-1.2kcal/mol?

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120205

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-3-28 23:47:57 | 只看该作者 Only view this author
下文说了,Multiwfn输出的范德华势的格点数据是kcal/mol为单位,自然isovalue也是kcal/mol,文中所有说道单位的地方没有不是kcal/mol的
谈谈范德华势以及在Multiwfn中的计算、分析和绘制
http://sobereva.com/551http://bbs.keinsci.com/thread-17271-1-1.html
使用Multiwfn对静电势和范德华势做拓扑分析精确得到极小点位置和数值
http://sobereva.com/645http://bbs.keinsci.com/thread-30769-1-1.html

可以这么理解(但不应当说成结合能,应当说成是范德华作用对相互作用能的贡献)
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-18 06:39 , Processed in 0.192274 second(s), 26 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list