做完IRC后的反应物和生成物的位置正好是反的

王若曦 · 发表于 Post on 2023-4-4 10:40:08

各位老师，我最近在做IRC，按照sob老师有关IRC计算和数据后处理的博文，我在m062x/g-31g*水平上计算得到了IRC数据，但是作图之后发现反应物和生成物的位置正好是反的。想问下这是怎么回事啊？我把irc的输入输出文件附上了！

chands · 发表于 Post on 2023-4-4 11:45:31

本帖最后由 chands 于 2023-4-4 11:48 编辑

位置正好相反倒没所谓，因为Gaussian也不知道你的反应方向啊，正反应逆反应是同一路径。你把帧调过来就行。
你的IRC就是两个羟基扭一下腰，什么反应啊？

王若曦 · 发表于 Post on 2023-4-4 11:51:53

chands 发表于 2023-4-4 11:45
位置正好相反倒没所谓，因为Gaussian也不知道你的反应方向啊，正反应逆反应是同一路径。你把帧调过来就行。 ...

是luminol的中间体化学激发过程，但我目前还没做到那一步。只是初猜了过渡态跑了一遍IRC。

sobereva · 发表于 Post on 2023-4-4 13:07:10

仔细看
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400（http://bbs.keinsci.com/thread-7736-1-1.html）

在IRC里可以用Reverse或Forward关键词让程序只往逆方向或者正方向一侧走IRC。经常有人问诸如怎么我写的是Reverse，但是Gaussian反倒往产物方向走了？或者，我让程序往两边走，走出来的IRC怎么左边是产物右边是反应物？那是因为哪边是反应物哪边是产物只有研究者自己知道，Gaussian知道的只是那是两个不同方向而已。如果你想明确让Gaussian知道指定哪边是正方向哪边是逆方向，需要在IRC里利用Phase关键词定义。

王若曦 · 发表于 Post on 2023-4-4 15:23:27

sobereva 发表于 2023-4-4 13:07
仔细看
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400（http://bbs.keinsci.com/thread- ...

好的，谢谢sob老师！

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