丁二烯基的IRI-pi如何分析

18392667184 · 发表于 Post on 2023-4-19 23:41:50

各位老师，我想分析一个1，3-丁二烯在双键C两端各掉一个H形成两种不同的自由基的共轭或者电子分布，采用了sob提出的IRI-pi绘制了如下图，还有环丁二烯自由基。由图(左、中、右用1、2、3代号吧)，可不可以看出，1联通的两个C-C键，其pi电子互相成90°呢，不在同一个平面。对比2看出， 1，3位置pi的方向都是一个方向。
不知道这样看对不对，还能获得什么信息呢，虽然看了IRI-pi的原文介绍，但还是一知半解，甚至一知半解都达不到。还有，3的环状这个怎么看呢，长的有点怪，不知道能怎么分析。还请各位大神指点指点。
附加问题：
1和2的这个化学命名应该如何命名呢，能体现自由基位置的，查了半天也没查到。(二-1,3-丁二烯基? 一-1,3-丁二烯基? 还是 2-1,3-丁二烯基？1-1,3-丁二烯基？感觉都不太对)

sobereva · 发表于 Post on 2023-4-20 05:24:54

对1可以看出

对

结合LOL-pi、自旋密度图考察

18392667184 · 发表于 Post on 2023-4-20 10:25:45

sobereva 发表于 2023-4-20 05:24
对1可以看出

对

老师，这是1和3的IRI-pi和LOL-pi。发现在1中最左边的C-H也有pi电子分布，这能认为是超共轭吗，如果不是，怎么理解。还有这个3的环丁二烯自由基这个分布，还是看不太懂，这个能看出什么信息呢。

sobereva · 发表于 Post on 2023-4-21 03:33:24

18392667184 发表于 2023-4-20 10:25
老师，这是1和3的IRI-pi和LOL-pi。发现在1中最左边的C-H也有pi电子分布，这能认为是超共轭吗，如果不是， ...

左边那部分是pi定域化轨道识别不当。要自行检查各个Multiwfn自动指认的pi型LMO，不合适的自行把占据数设0排除其贡献

可以计算一下对着的两个C之间的Mayer键级或者模糊键级，可能数值不是很小，暗示有跨空间的pi共轭作用。如果确实发现数值不小，可以再用NAdO方法把pi作用以轨道形式展现出来讨论
使用键级密度(BOD)和自然适应性轨道(NAdO)图形化研究化学键
http://sobereva.com/535（http://bbs.keinsci.com/thread-16453-1-1.html）

18392667184 · 发表于 Post on 2023-4-22 21:49:09

sobereva 发表于 2023-4-21 03:33
左边那部分是pi定域化轨道识别不当。要自行检查各个Multiwfn自动指认的pi型LMO，不合适的自行把占据数设0 ...

老师我看了一下检测到的轨道占据数都被设置成了0呀，可能是我不太懂。这个手动设置具体是咋操作呢?还请老师指导下。附带波函数文件。

C4H5.zip (374.63 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

sobereva · 发表于 Post on 2023-4-23 07:44:32

18392667184 发表于 2023-4-22 21:49
老师我看了一下检测到的轨道占据数都被设置成了0呀，可能是我不太懂。这个手动设置具体是咋操作呢?还请 ...

之后去主功能0看这些轨道的图形判断是否确实应当判断为pi轨道

主功能6的子功能26可以设置轨道占据数，下文都明确说了
在Multiwfn中单独考察pi电子结构特征
http://sobereva.com/432（http://bbs.keinsci.com/thread-10610-1-1.html）

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[波函数分析求助] 丁二烯基的IRI-pi如何分析