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[Gaussian/gview] 求助隐式溶剂模型下过渡态能垒计算

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楼主
本帖最后由 joke122 于 2023-4-20 17:26 编辑

各位老师好
     最近我在使用Gaussian程序在隐式溶剂模型下计算了一种离子盐的过渡态,想要研究一下反应路径,请问能垒是通过计算各个物质的溶质自由能做差得出吗,如果不是该用什么能量计算,如果是的话,对于我的初始反应物质还存在一个问题。该物质在气相下优化会发生分子内氢转移,这时候该如何处理呢,谢谢老师。

能量计算.docx

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发表于 Post on 2023-4-20 16:10:40 | 只看该作者 Only view this author
http://sobereva.com/620的要求修改帖子后我们再回答
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-20 17:30:41 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-4-20 16:10
按http://sobereva.com/620的要求修改帖子后我们再回答

老师,我修改完我的帖子了,请问这样可以吗

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发表于 Post on 2023-4-20 18:09:53 | 只看该作者 Only view this author
用自由能求差计算,看下文
谈谈如何通过势垒判断反应是否容易发生
http://sobereva.com/506http://bbs.keinsci.com/thread-14313-1-1.html

离子或局部显离子性体系,在溶液环境或者晶体环境下计算,至少带着隐式溶剂模型优化
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-21 09:47:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-20 18:09
用自由能求差计算,看下文
谈谈如何通过势垒判断反应是否容易发生
http://sobereva.com/506(http://bbs. ...

请问老师,那应该是再单独计算溶质自由能做差,还是用隐式溶剂模型下得到的整体自由能做差?

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发表于 Post on 2023-4-22 03:16:31 | 只看该作者 Only view this author
joke122 发表于 2023-4-21 09:47
请问老师,那应该是再单独计算溶质自由能做差,还是用隐式溶剂模型下得到的整体自由能做差?

隐式溶剂模型下得到的整体的自由能就是溶质的自由能
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-22 16:07:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-22 03:16
隐式溶剂模型下得到的整体的自由能就是溶质的自由能

了解了,谢谢老师

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