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[新手求助] 关于如何计算解离能

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计算新手学习请教,需要计算几个黄酮类化合物的解离能,哪位老师能够给我详细讲解一下如何计算等等吗,灰常感谢,在线等待~~

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发表于 Post on 2016-7-4 15:34:44 | 只看该作者 Only view this author
具体要解离什么?
如果是解离某个键,叫键解离能,整体能量减断键后两个片段能量就完了。记得整体和片段都要分别优化。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-4 15:54:20 | 只看该作者 Only view this author
谢谢sob老师的回复,是黄酮化合物酚羟基上O-H之间的断裂
按照您说的,就是分子能量减去解离产生的自由基能量和H原子的能量吗

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发表于 Post on 2016-7-5 03:47:09 | 只看该作者 Only view this author
奈落丢丢 发表于 2016-7-4 15:54
谢谢sob老师的回复,是黄酮化合物酚羟基上O-H之间的断裂
按照您说的,就是分子能量减去解离产生的自由基能 ...

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-5 09:10:08 | 只看该作者 Only view this author
谢谢您

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发表于 Post on 2019-11-19 17:01:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 木小虫427 于 2019-11-19 17:54 编辑

请问您是用的Gaussian还是MS?是需要构造一个包含几百个分子的模块算平均吗?需要考虑环境影响吗(比如固体溶于水之后解离,用考虑在模型中加入溶剂吗)?之前没有接触过解离能,想大概了解一下这个计算量大不大,需要时间长不长~希望您有时间可以指点一二,非常感谢!

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发表于 Post on 2019-11-20 02:20:12 | 只看该作者 Only view this author
木小虫427 发表于 2019-11-19 17:01
请问您是用的Gaussian还是MS?是需要构造一个包含几百个分子的模块算平均吗?需要考虑环境影响吗(比如固体 ...

M$里几乎只有Dmol3能算这类,但绝对不要用:
为什么我非常不建议购买和使用D摩3量子化学程序
http://sobereva.com/508

只需要用单个分子,恰当考虑质子化态,用溶剂模型就完了
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发表于 Post on 2019-11-20 11:40:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-20 02:20
M$里几乎只有Dmol3能算这类,但绝对不要用:
为什么我非常不建议购买和使用D摩3量子化学程序
http://so ...

嗯嗯,谢谢您的指点!~

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发表于 Post on 2019-11-28 11:18:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-7-4 15:34
具体要解离什么?
如果是解离某个键,叫键解离能,整体能量减断键后两个片段能量就完了。记得整体和片段都 ...

Sob老师好

我想问一下如果我想算环己烯的C=C双键解离能具体应该怎么操作,断键之后分子并不成两个片段,是应该在GaussView里面直接选中两个C然后取消键吗,还是应该怎么样呢?

谢谢您,祝您生活愉快

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发表于 Post on 2019-11-29 08:34:56 | 只看该作者 Only view this author
陈小北 发表于 2019-11-28 11:18
Sob老师好

我想问一下如果我想算环己烯的C=C双键解离能具体应该怎么操作,断键之后分子并不成两个片段 ...

用Gaussian分别计算每个片段

量化计算结果和键连关系根本毫无关系
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发表于 Post on 2019-11-30 19:12:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-29 08:34
用Gaussian分别计算每个片段

量化计算结果和键连关系根本毫无关系

是这样的老师



这是我的体系,它是一个环,我想计算图中双键的键解离能,这个双键断裂之后就是一个片段,我想问一下这种情况下怎么计算
谢谢老师

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发表于 Post on 2019-12-2 02:08:31 | 只看该作者 Only view this author

最简单的做法是通过Multiwfn计算Laplacian键级直接估计,看下文“键级分析”那一节的拉普拉斯键级的介绍
Multiwfn支持的分析化学键的方法一览
http://sobereva.com/471http://bbs.keinsci.com/thread-12488-1-1.html

另外的做法就是把对面的单键旋转180度使得双键破坏,然后用对称破缺单重态方式做个(限制性)优化再算个能量,与原先的求差。但这种做法不免掺进去其它因素。对称破缺单重态的计算参考
谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态
http://sobereva.com/82
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发表于 Post on 2022-6-27 11:02:14 | 只看该作者 Only view this author

sob老师好,我想咨询一下您解离后的片段应该表示为自由基还是离子?是否是想要考察均裂则用自由基计算,考察异裂则用离子计算?非常感谢!
No problem is insoluble in all conceivable circumstances.

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发表于 Post on 2022-6-27 15:21:52 | 只看该作者 Only view this author
naoki 发表于 2022-6-27 04:02
sob老师好,我想咨询一下您解离后的片段应该表示为自由基还是离子?是否是想要考察均裂则用自由基计算, ...

是的
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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发表于 Post on 2022-6-27 16:44:36 | 只看该作者 Only view this author

好的,谢谢王老师
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