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[ORCA] 求助orca优化Cu16Pd1簇结构输入文件写法

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楼主
orca新手,用的orca版本5.0.4,请问一下大家,如果优化339个原子的Cu16Pd簇用下面的

! B97-3c opt noautostart miniprint nopop
%maxcore  5000
%pal nprocs   13 end
* xyz   0   1

坐标
*

还是
! B3LYP D3 def2-TZVP(-f) def2/J RIJCOSX opt noautostart miniprint nopop
%maxcore  x
%pal nprocs   y end
* xyz   0   1

坐标
*

比较好?还有就是def2应该是对Pd自动加了赝式基组把,如果我对铜也加赝式,下面的写法对吗?

! B3LYP D3 def2-TZVP(-f) def2/J RIJCOSX opt noautostart miniprint nopop
%maxcore  x
%pal nprocs   y end
%basis
ECP{LanL=[Cu]} end
end
* xyz   0   1

坐标
*


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发表于 Post on 2023-4-22 23:35:25 | 只看该作者 Only view this author
http://sobereva.com/272选泛函
对铜用赝势的话,需要用NewGTO和NewECP关键字,具体写法在手册里搜
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2023-4-22 23:49:50 | 只看该作者 Only view this author
体系太大,应该从b97-3c 开始试,而且怀疑超算几天能算出来。
另外按Grimme 组去年DFT protocol文章,B3LYP对于b97-3c 的优化结果并没有优势

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发表于 Post on 2023-4-23 08:02:30 | 只看该作者 Only view this author
B3LYP算这种体系没任何优点
ORCA靠RIJ,用B97-3c纯泛函计算对这种大体系远比用RIJCOSX的B3LYP快,结果也不比用B3LYP差,输入文件写起来还省事
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-23 11:43:12 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-4-22 23:35
按http://sobereva.com/272选泛函
对铜用赝势的话,需要用NewGTO和NewECP关键字,具体写法在手册里搜

多谢老师,不知道为啥orca官网上不去,特殊手段也不行。我看到有Gaussian Vs ORCA里面写到ECP时有以下关键词,然后我就用了第一个。
ECP{LanL=[Rh]}[/b]
ECP{LanL=[Rb-Ag]}
ECP{LanL=[Rh],def2-TZVP/J}
ECP{LanL=[Rh],LanLDZ,def2-TZVP/J}

我看到要对某些原子指定基组的时候用到%basis NewGTO 元素 “基组” end这种写法。
ECP这里我不太懂,下面这样写可以吗?
! B3LYP D3 def2-TZVP(-f) def2/J RIJCOSX opt noautostart miniprint nopop
%maxcore  x
%pal nprocs   y end
%basis
NewECP Cu "lanl2" end (还需要在这下面加一行写NewGTO吗?)
NewGTO Cu "lanl2dz" end(这一行需要吗?)
end
* xyz   0   1

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-23 11:44:41 | 只看该作者 Only view this author
dnlx 发表于 2023-4-22 23:49
体系太大,应该从b97-3c 开始试,而且怀疑超算几天能算出来。
另外按Grimme 组去年DFT protocol文章,B3LY ...

好的,多谢老师,我用B97-3C跑起来了。条件限制只能16核,每个核分配大概6G,不知道能不能跑出来

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-23 11:45:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-23 08:02
B3LYP算这种体系没任何优点
ORCA靠RIJ,用B97-3c纯泛函计算对这种大体系远比用RIJCOSX的B3LYP快,结果也不 ...

多谢sob老师,用B97-3c跑起来了。

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发表于 Post on 2023-4-23 15:07:23 | 只看该作者 Only view this author
Huyang 发表于 2023-4-23 04:43
多谢老师,不知道为啥orca官网上不去,特殊手段也不行。我看到有Gaussian Vs ORCA里面写到ECP时有以下关 ...

需要NewGTO
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-9 20:02:46 | 只看该作者 Only view this author
感谢大家,我把配体的一些柔性基团用H代替,用B97-3C,36核,每个核5G,跑了2天12h正常收敛。

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