关于计算离子晶体的紫外可见光谱时的溶剂模型的问题

ppy412 · 发表于 Post on 2023-4-26 18:13:14

各位老师好，我计算的晶体是一个H2BPYBC二价阳离子的两端分别和一个均苯三甲酸阴离子形成氢键，但周围还有若干个均苯三甲酸阴离子存在，和其他的H2BPYBC二价阳离子形成氢键。我想问一下:
①结构是否可以只选这个H2BPYBC二价阳离子和与其形成氢键的两个均苯三甲酸阴离子？
②溶剂模型是否可以取均苯三甲酸阴离子的eps和epsinf？(查阅到eps为5.5)
③我计算的结果S1的波长达到了10000nm(使用TDDFT计算)，这个结果应该是不能用的，那是否可以用TDA或者CIS进行计算？
谢谢老师解答。

sobereva · 发表于 Post on 2023-4-26 23:44:24

1 所有近邻的都得纳入，不是光看是否形成氢键

3 不说具体计算级别问这个毫无意义

如果你的目的是算整个晶体的光谱，建议按下文做
使用CP2K结合Multiwfn对周期性体系模拟UV-Vis光谱和考察电子激发态
http://sobereva.com/634（http://bbs.keinsci.com/thread-28006-1-1.html）

如果你的目的是只算阳离子部分的局域激发，忽略阴离子的局域激发以及阴阳离子间的电荷转移激发，应当按下文做，否则阴离子也会对光谱有贡献
基于背景电荷计算分子在晶体环境中的吸收光谱
http://sobereva.com/579（http://bbs.keinsci.com/thread-20960-1-1.html）

ppy412 · 发表于 Post on 2023-4-27 09:25:52

本帖最后由 ppy412 于 2023-4-27 09:30 编辑

sobereva 发表于 2023-4-26 23:44
1 所有近邻的都得纳入，不是光看是否形成氢键

3 不说具体计算级别问这个毫无意义

谢谢老师的解答，我目前没有linux系统，没法使用CP2K，请问老师，我不仅想要探究阳离子的局域激发，也想探究阴阳离子之间的电荷转移和阴离子的局域激发，那么我取阳离子和近邻的几个阴离子，然后溶剂设置为近邻离子的eps和epsinf，这样的结果是可以接受的吗？
我用的计算级别是PBE0/6-31+g*

sobereva · 发表于 Post on 2023-4-28 12:30:22

ppy412 发表于 2023-4-27 09:25
谢谢老师的解答，我目前没有linux系统，没法使用CP2K，请问老师，我不仅想要探究阳离子的局域激发，也想 ...

自己装个linux虚拟机用CP2K就完了

并不准确。既然阴离子的激发也纳入考虑，地位应当和阳离子等同，然而处在外围的阴离子的周围的阳离子环境又没充分表现

ppy412 · 发表于 Post on 2023-4-28 17:08:11

sobereva 发表于 2023-4-28 12:30
自己装个linux虚拟机用CP2K就完了

并不准确。既然阴离子的激发也纳入考虑，地位应当和阳离子等同，然 ...

好的，谢谢老师，那如果把考虑的阴离子和阳离子周围铺上背景电荷，那么是和文章中一样分别计算，还是整体计算以考虑耦合比较好呢？

sobereva · 发表于 Post on 2023-4-30 03:02:23

ppy412 发表于 2023-4-28 17:08
好的，谢谢老师，那如果把考虑的阴离子和阳离子周围铺上背景电荷，那么是和文章中一样分别计算，还是整体 ...

直接当周期性体系计算是完美的

用背景电荷也可以，但无法体现中心分子与环境分子的电荷转移作用。但也可以取不同的阴阳离子对以这种方式分别计算

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[综合交流] 关于计算离子晶体的紫外可见光谱时的溶剂模型的问题

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