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[CP2K] 求助,第一次跑CP2K的AIMD,我这样的输入文件有问题吗?

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各位老师好,我想用AIMD模拟一个水与杂化钙钛矿界面的相互作用的模型。现在先做了toy system想先测试一下,toy system如图所示。

cp2k的输入文件我是用Multiwfn生成的,我上传到这里供大家检查。在运行测试之前有一些问题想问一下各位老师:


1. 对于水与杂化钙钛矿混合的系统,SCF使用OT算法更好还是对角化算法更好?
2. 这个toy system我的目标是在300K下运行。请问我是否应该先在NVE系综下将系统温度升高到300K跑到平衡态?还是直接使用NVT系统,CSVR热浴直接将系统从头加热,直至系统平衡?(这一部分因为第一次跑AIMD,许多概念不是很清楚)
3. TIMECON设置500是比较适中的选择吗。这个参数的选择和系统的大小有没有关系。因为目前的toy system是200多个原子,最后想运行的production run是在500多个原子。
4. 想看体系的能量是否收敛,应该plot .ener文件中的Pot.那一列的能量还是.out文件中的total energy能量呢?

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发表于 Post on 2023-5-2 15:19:01 | 只看该作者 Only view this author
1 OT。

2 用NVE根本就没法控制温度。如果你是指按照300K来初始化速度,跑一阵子之后离300K肯定偏得很远。应当用NPT

3 500太大,一般用100-200
跟大小无关。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-2 15:30:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-2 15:19
1 OT。

2 用NVE根本就没法控制温度。如果你是指按照300K来初始化速度,跑一阵子之后离300K肯定偏得很远 ...

谢谢soberava老师回复,我其实是想观察水对钙钛矿分解作用的过程。所以应该是是先用NPT系综,温度设置300K,将系统跑到平衡状态之后(温度在300K波动,能量收敛),再用NVT系综,设置300K来跑production run吗?
我在文献里看到他们只写了最后跑AIMD的参数(大多数人用nose热浴,timeconstant设置15左右),所以想问一下需要怎么设置来把系统运行到平衡态更好。

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4#
发表于 Post on 2023-5-2 15:39:00 | 只看该作者 Only view this author
Weldingspock 发表于 2023-5-2 15:30
谢谢soberava老师回复,我其实是想观察水对钙钛矿分解作用的过程。所以应该是是先用NPT系综,温度设置300 ...

干嘛非要用NVT?
NOSE热浴过时了。一律用CSVR
别盲目效仿文献
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-2 15:55:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-2 15:39
干嘛非要用NVT?
NOSE热浴过时了。一律用CSVR
别盲目效仿文献

好的老师,我试一下NPT。文献里都用NVT我也觉得挺奇怪的……

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