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[新手求助] 求助计算核磁

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求助各位大神,计算化学非我的本专业。

如果我有计算ECD的基础,再去学习计算NMR的操作,难掌握吗?有哪位大神能提供帮助吗?万分感谢!

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发表于 Post on 2016-7-10 17:04:42 | 只看该作者 Only view this author
算ECD跟NMR没有直接联系。
如果你已经会用Gaussian算ECD,算个NMR只是改个关键词的事,没什么复杂的。
G09里算核磁最好的是B972泛函,对小体系用pcSseg-2基组,对大体系用pcSseg-1基组是最佳选择(这俩基组去EMSL上拷定义)
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-10 18:07:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-7-10 17:04
算ECD跟NMR没有直接联系。
如果你已经会用Gaussian算ECD,算个NMR只是改个关键词的事,没什么复杂的。
G0 ...

但是最后是用什么软件进行Boltzmann拟合呢?我计算ECD用的SpecDIS

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发表于 Post on 2016-7-10 20:36:07 | 只看该作者 Only view this author
healthyworld 发表于 2016-7-10 18:07
但是最后是用什么软件进行Boltzmann拟合呢?我计算ECD用的SpecDIS


不是boltzmann拟合而是boltzmann加权平均
ECD都用不着什么额外的程序,直接用multiwfn产生各个构象ECD曲线(http://sobereva.com/224),分别导出来,一起放到origin里,分别乘上玻尔兹曼分布比例,然后加和,最后绘制曲线图就完了。多构象的NMR的绘制过程也一样(但Multiwfn、gview没法给出NMR谱的曲线图来,gview只是依据Gaussian输出信息给出离散竖线图)。
但如果牵扯到构象变化速度接近或快于NMR时标的情况,事情比较麻烦,不是上述简单的叠加关系。
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发表于 Post on 2020-5-5 14:59:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-7-10 20:36
不是boltzmann拟合而是boltzmann加权平均
ECD都用不着什么额外的程序,直接用multiwfn产生各个构象ECD ...

老师,如果化合物搜索的构象特别多,我只取大于1%或者10%的进行计算。那NMR的化学位移怎么进行加权呢

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发表于 Post on 2020-5-6 08:52:35 | 只看该作者 Only view this author
381911577 发表于 2020-5-5 14:59
老师,如果化合物搜索的构象特别多,我只取大于1%或者10%的进行计算。那NMR的化学位移怎么进行加权呢

这事很复杂,不光看构象分布比例,还得看当前环境下构象之间变化是否足够快


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发表于 Post on 2020-5-6 15:08:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-5-6 08:52
这事很复杂,不光看构象分布比例,还得看当前环境下构象之间变化是否足够快

老师,我直接选取了大比例的构象,加权后除以这些构象的总和。这样得到的结果也很符合,那我这种结果可以用来发文章吗?

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发表于 Post on 2020-5-7 08:41:12 | 只看该作者 Only view this author
381911577 发表于 2020-5-6 15:08
老师,我直接选取了大比例的构象,加权后除以这些构象的总和。这样得到的结果也很符合,那我这种结果可以 ...

可以
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sobereva 发表于 2016-7-10 17:04
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sob老师好,我是个计算小白,想计算一个化合物的NMR,您说的这个机组和方法具体怎么写在sub文件里面呢?分子需要先做构型优化吗?
谢谢大神!

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发表于 Post on 2020-9-10 03:58:12 | 只看该作者 Only view this author
starskyyy 发表于 2020-9-9 14:14
sob老师好,我是个计算小白,想计算一个化合物的NMR,您说的这个机组和方法具体怎么写在sub文件里面呢? ...

我不知道你说的sub是什么

怎么做这里写了
谈谈如何又好又快地计算NMR化学位移
http://sobereva.com/354http://bbs.keinsci.com/thread-4434-1-1.html

在Multiwfn最新版手册4.11.10节中,也给出了计算和绘制NMR的例子,一看就会
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