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[GROMACS] 求助AMBER99SB立场中金原子的LJ参数

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请问大家有没有关于金原子在AMBER99SB力场下的LJ参数的资料之类的,我想将金纳米颗粒这种载体也一起引入到GROMACS的MD模拟中,力场选择的是AMBER99SB,但是没有找到这个力场下的金原子的LJ参数,只找到了UFF力场下的金原子的参数,请问UFF力场下的LJ参数适用于AMBER99SB力场吗,或者是有什么方法可以转换吗?
另外,我根据一些博主推荐的一些查找LJ参数的网址去查找金原子的LJ参数,为什么有些只显示金原子的LJ参数,但不显示适用的力场,这种类型的LJ参数是不是不能使用呢?

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发表于 Post on 2023-5-10 22:31:09 | 只看该作者 Only view this author
这个JPCC里的力场可以跟AMBER/GAFF力场结合使用




UFF并不支持金属单质,参数都是对于化合物状态而言的
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-11 08:47:10 | 只看该作者 Only view this author
好的好的,感谢sob老师的回答!

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