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[新手求助] 求助:用MP2方法算单点,从高斯输出文件中如何查看并计算

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楼主
各位老师好!审稿人让我用post HF方法去计算一下单点,因为文章中使用DFT方法计算的两个过渡态的能量差只有0.6 kcal/mol,所以我尝试了MP2方法、MP4方法、CBSQB3方法,还有ORCA的DLPNO-CCST(T)方法,目前存在一些疑惑,请各位老师指导!

①用MP2方法,能够正常结束,但是我不太清楚这两个过渡态的能量差是多少,我不知道如何去统计,在这个帖子中提到了查看用MP2方法计算的电子能量谈谈该从Gaussian输出文件中的什么地方读电子能量 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com),但是具体还是不太清楚应该怎么算。关于两个过渡态的out文件已经随附件上传。
②MP4方法,出现的错误是g_write,硬盘内存的原因,一开始遇到这个问题的时候我将高斯计算的临时文件/Scratch夹改成了我的主目录,结果还是会出现这种报错,这种情况应该怎么解决?
③用ORCA的DLPNO-CCSD(T)方法计算两个过渡态的单点,虽然结尾都是ORCA TERMINATED NORMALLY,但是我查看单点能量,波函数是不完全收敛的(FINAL SINGLE POINT ENERGY     -3088.079387890857   (Wavefunction not fully converged!)),我看网上都是直接出现SCF不收敛,查阅ORCA手册,尝试加了slowconv,以及降低收敛限,最终的结果都是一样的(正常结束,但是波函数不完全收敛),不知道这种情况应该怎么办?关于用ORCA计算的输出文件已随附件上传

希望各位老师方便的时候可以指点我一下,十分感谢!

TSb2-mp2.out

140.48 KB, 下载次数 Times of downloads: 11

TSb4-mp2.out

341.29 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

TSb4-2.out

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发表于 Post on 2023-5-15 19:47:36 | 只看该作者 Only view this author
直接上DLPNO-CCSD(T)就完了,根本没必要考虑其它的。MP2的结果通常还不如DFT(泛函选择恰当时)

DLPNO-CCSD(T)计算前先手动做个HF计算,并且用论坛、手册里提到的各种方法把SCF弄收敛了。必要时也可以读取Gaussian产生的波函数,看下文。HF顺利做完了之后,DLPNO-CCSD(T)任务再去读取HF的gbw文件里的波函数当初猜
将Gaussian等程序收敛的波函数作为ORCA的初猜波函数的方法
http://sobereva.com/517http://bbs.keinsci.com/thread-14905-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-15 20:47:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-15 19:47
直接上DLPNO-CCSD(T)就完了,根本没必要考虑其它的。MP2的结果通常还不如DFT(泛函选择恰当时)

DLPNO-C ...

谢谢sobereva老师,那MP2方法计算得到的输出文件,具体应该怎么看呢,我想也统计看一下能量差

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发表于 Post on 2023-5-16 10:32:15 | 只看该作者 Only view this author
哇卡卡卡卡卡 发表于 2023-5-15 20:47
谢谢sobereva老师,那MP2方法计算得到的输出文件,具体应该怎么看呢,我想也统计看一下能量差

《谈谈该从Gaussian输出文件中的什么地方读电子能量》http://sobereva.com/488
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-16 15:45:36 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-5-16 10:32
《谈谈该从Gaussian输出文件中的什么地方读电子能量》http://sobereva.com/488

老师,我根据帖子还有高斯手册,查到了对应的E值
老师我还有一个疑惑:我应该如何得到G值呢,第一次接触post HF方法,前面用DFT方法计算时,算freq时会得到gibbs校正值,那么在post HF方法中,我觉得就不能用前面的这个gibbs校正值了吧,是需要重新用MP2方法算一个freq还是用HF方法去算freq,或者都不是,希望老师方便的时候指导我一下

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发表于 Post on 2023-5-16 15:48:37 | 只看该作者 Only view this author
哇卡卡卡卡卡 发表于 2023-5-16 15:45
老师,我根据帖子还有高斯手册,查到了对应的E值
老师我还有一个疑惑:我应该如何得到G值呢,第一次接触 ...

在此文中搜“粗人”和“讲究的人”
《谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算》http://sobereva.com/327
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-16 16:59:02 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-5-16 15:48
在此文中搜“粗人”和“讲究的人”
《谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算》http://soberev ...

谢谢老师的指导!

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