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[新手求助] B掺杂石墨炔的团簇模型该如何构建?

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本帖最后由 赵寅生 于 2023-5-16 14:30 编辑

各位老师好,我先用VASP计算了B掺杂石墨烯的结构,输出文件里mag=0,说明这个体系的磁矩为0。现在我想用高斯做分析,就想着需要截取出团簇模型,我看了一些文献,出现过这种结构,如图B-石墨炔。但是该团簇结构(B-石墨炔)是2重态。与我设想的:磁矩为0,说明全部的电子都配对,即单重态,两者不太一致。
1、所以我想的是我结构的搭建是否有问题,如果需要更改的话,应该如何处理呢?

2、我计算了现在这个结构的芳香性-NICS(1)zz,即NICS在上方1埃处这一平面内是如何分布的,想讨论B掺杂后会影响局部的芳香性,但是发现在石墨炔的三角空洞处呈现出反芳香性,这种情况和我预想的不太一致(本征石墨炔的三角形空洞处也是反芳香性的。)因为我觉得石墨炔在空洞处,不能稳定吸附中间体,为何会呈现出较大的NICS值呢?




B掺杂石墨炔.png (102.89 KB, 下载次数 Times of downloads: 4)

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发表于 Post on 2023-5-16 18:13:30 | 只看该作者 Only view this author
1. 你团簇里包含两个B(例如取1x1x2的超胞),电子就可以配对了。原因是显然的。
2. NICS和是否能稳定吸附中间体没有任何关系,不知道你最后一个问题为什么那么问
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2023-5-16 21:42:04 | 只看该作者 Only view this author
2 本来就能吸附,用Multiwfn画个范德华势图一目了然
谈谈范德华势以及在Multiwfn中的计算、分析和绘制
http://sobereva.com/551http://bbs.keinsci.com/thread-17271-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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