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[CP2K] CP2K运行时内存使用率不高,求助内存使用设置

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请教各位老师:我用MS构建了一个supercell,利用gview固定了底部某些原子(在此感谢sob老师提供的固定原子方法),inp文件(具体请见附件TiO2.inp)中设置了“ MAX_MEMORY 40000 #Memory(MB) per MPI process for calculating HF exchange”(Memory数值设置欠考虑),CP2K运行时内存使用率不高(使用情况请见截图“CPU RAM使用情况”,服务器配置:CPU 7R32*2;RAM 512G),请问如何提高CP2K运行时内存使用率(毕竟前面MAX_MEMORY 40000设置挺高,但实际使用率还是没上去)?如何设置才能使out文件中每个step计算时间缩短(目前正在计算中,把目前生成的out文件也贴出,目前每个step耗时要150s左右)?请各位老师不吝指教!谢谢!





CPU RAM使用情况.png (3.82 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)

CPU RAM使用情况.png

TiO2.inp

22.08 KB, 下载次数 Times of downloads: 12

TiO2.inp文件

TiO2.out

13.11 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

TiO2.out文件

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发表于 Post on 2023-5-16 21:29:15 | 只看该作者 Only view this author
用popt版,甭用ssmp

输入文件还有个硬伤。当前用了SCREEN_ON_INITIAL_P T,应当读取纯泛函的wfn文件当初猜,否则结果基本没意义还几乎不能收敛,下文也明确说了
解决CP2K中SCF不收敛的方法
http://sobereva.com/665http://bbs.keinsci.com/thread-37196-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-16 22:01:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-16 21:29
用popt版,甭用ssmp

输入文件还有个硬伤。当前用了SCREEN_ON_INITIAL_P T,应当读取纯泛函的wfn文件当初 ...

谢谢sob老师!初看了665帖子,再看inp文件,发现inp文件中有一句是:
#     SCF_GUESS RESTART #Use wavefunction from WFN_RESTART_FILE_NAME file as initial guess
      &OT
也就是SCREEN_ON_INITIAL_P T与读取纯泛函的wfn文件并存?
想要“读取纯泛函的wfn文件当初猜”,请问如何调整inp文件?
另请教,有单分子用ssmp优化过了,请问还需用popt版再次优化吗?二者是否一致?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-16 22:10:20 | 只看该作者 Only view this author
刚看了这个帖子:http://bbs.keinsci.com/thread-28312-1-1.html
先做纯泛函,然后再读取纯泛函的波函数进行杂化泛函计算,这样理解没错吧

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发表于 Post on 2023-5-16 22:24:10 | 只看该作者 Only view this author
jim 发表于 2023-5-16 22:01
谢谢sob老师!初看了665帖子,再看inp文件,发现inp文件中有一句是:
#     SCF_GUESS RESTART #Use wav ...

不需要。一致

参考北京科音CP2K第一性原理计算培训班ppt


北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2023-5-16 22:24:30 | 只看该作者 Only view this author
jim 发表于 2023-5-16 22:10
刚看了这个帖子:http://bbs.keinsci.com/thread-28312-1-1.html
先做纯泛函,然后再读取纯泛函的波函数进 ...

没错
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-16 22:44:47 | 只看该作者 Only view this author
谢谢!请问纯泛函计算时是否需要 2 DFT-D3(BJ)?不色散校正是否有影响?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-17 22:00:46 | 只看该作者 Only view this author

用Multiwfn将inp文件改为PBE,其余不便,PBE也不是很容易收敛啊,这都快一天了连“Decrease in energy         =                   NO”状态都没变成YES,
真是忐忑
另外,CPU还是可以满载,内存还是只用到大约40G/512G,不知如何提高内存使用率

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发表于 Post on 2023-5-18 00:03:10 | 只看该作者 Only view this author
jim 发表于 2023-5-16 22:44
谢谢!请问纯泛函计算时是否需要 2 DFT-D3(BJ)?不色散校正是否有影响?

谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobereva.com/413http://bbs.keinsci.com/thread-9772-1-1.html
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发表于 Post on 2023-5-18 00:04:11 | 只看该作者 Only view this author
jim 发表于 2023-5-17 22:00
用Multiwfn将inp文件改为PBE,其余不便,PBE也不是很容易收敛啊,这都快一天了连“Decrease in energy    ...

分清楚SCF收敛和几何优化收敛
从来没说改成PBE就能让几何优化更容易收敛

内存该用多少用多少,自己确保运行方式、安装方式、输入文件合理就完了
不提供当下实际具体信息没法说
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