计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1471|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[VASP] 求助POSCAR确定原子序号的方法

[复制链接 Copy URL]

93

帖子

0

威望

557

eV
积分
650

Level 4 (黑子)

最近做COHP分析时,lobsterin文件需要指定在那几个原子算cohp。想查看相应的原子编号,但是POSCAR格式的文件拖进Gaussian view没有反应,是否有相应的软件能显示相应的原子编号呢

361

帖子

0

威望

1991

eV
积分
2352

Level 5 (御坂)

所念皆星河

2#
发表于 Post on 2023-5-23 17:13:34 | 只看该作者 Only view this author
用vesta打开看
心之所向,日复一日,必有精进

93

帖子

0

威望

557

eV
积分
650

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-23 17:51:40 | 只看该作者 Only view this author

可以这样理解吗。先查看POSCAR的原子顺序,找出相应元素在那几行。在根据vesta标签看对应行是那个原子

202305231752172076..png (194.58 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

202305231752172076..png

353

帖子

1

威望

1977

eV
积分
2350

Level 5 (御坂)

4#
发表于 Post on 2023-5-23 17:53:36 | 只看该作者 Only view this author
非用GaussView的话,用最新下载的Multiwfn载入POSCAR然后输入gi按两下回车,生成对应的gjf文件,可以用GaussView打开看序号,和POSCAR里是一样的。用VMD也可以载入POSCAR。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +2 收起 理由
Reason
sobereva + 2 正解

查看全部评分 View all ratings

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112466

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2023-5-23 19:43:59 | 只看该作者 Only view this author
也可以Multiwfn载入POSCAR之后在主功能0里直接看序号
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

361

帖子

0

威望

1991

eV
积分
2352

Level 5 (御坂)

所念皆星河

6#
发表于 Post on 2023-5-24 00:25:43 | 只看该作者 Only view this author
wmy 发表于 2023-5-23 17:51
可以这样理解吗。先查看POSCAR的原子顺序,找出相应元素在那几行。在根据vesta标签看对应行是那个原子

是的。如果POSCAR用vaspkit处理过的话,每行后面会带有元素及编号,对照起来更方便
心之所向,日复一日,必有精进

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-26 14:31 , Processed in 0.336286 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list