[GROMACS] g_mmpbsa能量拆分做b因子着色图

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发表于 Post on 2023-6-14 21:11:15 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励

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求助各位老师们，在g_mmpbsa教程中，分步计算能量的时候使用的时1EBZ.tpr文件，而在使用VMD对拆分能量进行b因子着色的时候使用的是1EBZ_pbc_corrected.tpr，这两个tpr文件有什么区别吗？我该怎样获得这样的_pbc_corrected.tpr。（我想给自己的模拟做一个可视化能量着色图，使用了分布计算能量时的tpr文件，生成的pdb文件没有坐标信息所以怀疑tpr文件使用错误。但不知道怎么解决）

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