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[CP2K] 关于CP2K中添加限制势做AIMD模拟的问题求助

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想做一个水分子诱导催化剂表面重构的模拟,因此希望通过添加限制势来实现让水分子靠近催化剂表面,导致催化剂表面重构。

具体做法是参考这篇文献(doi.org/10.1021/acscatal.8b01232)中的SI部分(见图1)。



我在inp文件中对限制势的设置如图2。其中1-141是指定所有水分子中的原子,Z0取值为催化剂表面的z值,B是参考文献公式计算近似取的值。具体文件见附件。



用NVT跑了2.7ps,结构从图3变为了图4。



求助的问题是:1.目前的结果看来水分子中有一部分往上走,有一部分往下走,这是否说明催化剂(Cu2O)表面对水分子吸附的影响要强于限制势的影响(即不加限制势情况下跑NVT也能得到这种结果,加限制势用处不大?) 2.如果希望真空层上方的水分子全部靠近催化剂表面,甚至发生水的解离应该怎么做?





cu2o_water1.inp

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发表于 Post on 2023-6-26 17:02:58 | 只看该作者 Only view this author
没有跑过类似的体系,但是好奇一下2ps过后的水分子分布一点都不随机。尤其是上方的水分子部分

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-26 22:18:51 | 只看该作者 Only view this author
您好,我觉得不随机主要可能有两个因素影响,一个是加的限制势,一个是催化剂对水的相互作用。我认为是限制势的影响起到了作用,但我想知道并讨论的是:1)理论上来讲,不加限制势去跑NVT,靠Cu2O对H2O的相互作用是否也能得到类似的结果(即限制势影响很小)?。2)不管如何,从结果来看目前所加的限制势并没有达到我想要的结果(想让水全部下来靠近催化剂表面,水发生解离)。要达到此效果,按那篇文献所展示的图来看,是否需要对限制的FUNCTION按Z进行分段?(在离催化剂表面较远的上部施加一个常数的限制势,而在离催化剂表面较近处施加一个随|(Z-Z0)|的减小而减小的函数?如果这样不行不知道还有没有其他方法可以实现,希望能够得到指点,其他问题也欢迎讨论。

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发表于 Post on 2023-6-26 23:25:26 | 只看该作者 Only view this author
直接跑固-液界面体系,可以当三维周期性计算,上、下层发生的现象也可以都研究
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