在周期性结构中提取了部分结构，限制性优化出现变形的问题

筱婷397 · 发表于 Post on 2023-7-4 09:23:36

请教一下，参照sob老师的方法在周期性结构中提取了部分结构，冻结了周围的C原子，并用H饱和，随后用Gaussian优化簇模型之后，角度改变与实际结构相差较大的结果可以用吗？或者有什么解决方法吗？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-7-4 15:31:57

这个周期性结构是实验结构还是计算结构？如果是计算结构，理论级别和你的簇模型所用理论级别是否相符？

筱婷397 · 发表于 Post on 2023-7-4 16:04:33

wzkchem5 发表于 2023-7-4 15:31
这个周期性结构是实验结构还是计算结构？如果是计算结构，理论级别和你的簇模型所用理论级别是否相符？

感谢老师的回复，这个周期性结构是在文献中下载的优化好的结构，文献中用VASP优化的，参数如下图所示。我在这个文献中给出的优化好的结构基础上，提取部分结构固定C原子后用Gaussian计算的，其中镧系元素采用的是PBE0结合SDD赝势，其他元素采用6-31G*。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-7-4 17:42:52

筱婷397 发表于 2023-7-4 09:04
感谢老师的回复，这个周期性结构是在文献中下载的优化好的结构，文献中用VASP优化的，参数如下图所示。我 ...

那结果有这个量级的差异是正常的，泛函不同、赝势不同、基组不同任何一条都足以改变你画的那个键角

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[Gaussian/gview] 在周期性结构中提取了部分结构，限制性优化出现变形的问题