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[建模与可视化] GaussianView 建模分子如何实现绕轴旋转

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模仿文献做分子的旋转能垒分析的时候,想要旋转整个分子再插值做CL-NEB。但是Gaussianview里面旋转角度只能指定三个原子进行旋转。有没有类似MS里面直接旋转整个分子的功能呢? 如果用ms来做,如何导出Gaussian格式的gjf呢?

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发表于 Post on 2023-7-7 12:48:25 | 只看该作者 Only view this author
那叫GaussView
GaussView不能(除非添加一些辅助原子)
用Multiwfn可以直接实现
Multiwfn中非常实用的几何操作和坐标变换功能介绍
http://sobereva.com/610http://bbs.keinsci.com/thread-24674-1-1.html
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2023-7-7 17:48:32 | 只看该作者 Only view this author
如果你对旋转的角度没有定量要求,GaussView 也可以实现旋转功能。

按住 Alt 键(注意,是按住 Alt 键,不是只按一下),然后用鼠标左键拖动要旋转分子就可以实现任意角度的旋转了。当然,再次强调,这个操作不能定量,也就是旋转的角度是靠你的手来决定的,没法精确到旋转多少角度。

另外,需要注意的是,你如果只是旋转某个局部的结构,你需要先用距离工具断开你要旋转的部分和不旋转的部分之间的连接。

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