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[CP2K] 500个原子的吸附模型CP2K感觉算起来好慢,不知道这个速度正常不正常

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我是在超算上面装的CP2K 2023
之前一直用的第一次CP2K培训的案例文件,能量部分的计算时间和卢老师给的文件大差不差。
这次自己弄了一个体系,500个Fe原子吸附一个有机分子,500多个原子,用的GFN1-xtb,算的速度好慢,7个小时结构优化才走了一步(超算给的16核)。
不知道是我计算设置的问题还是还是软件安装的问题。

Fe n.inp

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slurm-7168813.out

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发表于 Post on 2023-7-9 03:42:44 | 只看该作者 Only view this author
绝对不要用PSOLVER ANALYTIC。一定不要用太老版本的Multiwfn。较新版本的Multiwfn对二维周期性体系一律用MT,比ANALYTIC强多了。

slab完全没必要建得这么大,极度浪费时间。用小点slab并结合k点效率高得多

Fe的slab是具有磁性的,参考北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)里“磁性体系的计算”那部分的讲解

GFN1-xTB跑这种体系是否理想不一定,如果没有类似体系的研究文章做支撑,可能会被审稿人质疑。但凡DFT算得动就用DFT

Fe slab是导体,smearing显然必须开。你当前几何优化每一步做了巨量次数的outer SCF才收敛,显然效率太低了。一定要注意监控

下文仔细看看
解决CP2K中SCF不收敛的方法
http://sobereva.com/665http://bbs.keinsci.com/thread-37196-1-1.html

如果用的psmp应当用popt,并且当前体系很大,多给点核并行


北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-9 09:27:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-7-9 03:42
绝对不要用PSOLVER ANALYTIC。一定不要用太老版本的Multiwfn。较新版本的Multiwfn对二维周期性体系一律用MT ...

谢谢卢老师!!!我再试试!

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