求助：用gromacs教程模拟向盒子中填充溶剂及离子并进行能量最小化时系统报错

wanzongliang · 发表于 Post on 2023-7-14 16:04:52

各位大佬好，本人小白。在进行GROMACS教程：漏斗网蜘蛛毒素肽的溶剂化研究的模拟时在真空中能量最小化的步骤出现问题，用的是他给的能量最小化文件，报错结果如图
他说的top文件出现问题，应该怎么改top文件才好呢

Arkin · 发表于 Post on 2023-7-14 16:50:41

不用管，后边会有步骤中和它。为了按教程继续，添加选项：`-maxwarn 1` 先忽略这个提示。

wanzongliang · 发表于 Post on 2023-7-14 19:50:47

Arkin 发表于 2023-7-14 16:50
不用管，后边会有步骤中和它。为了按教程继续，添加选项：`-maxwarn 1` 先忽略这个提示。

好的我知道了，万分感谢

UTM · 发表于 Post on 2023-7-14 21:14:56

这个是warning，不是报错

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[GROMACS] 求助：用gromacs教程模拟向盒子中填充溶剂及离子并进行能量最小化时系统报错