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[辅助/分析程序] 求助USPEX (V 9.4.4)如何在本地运行

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本帖最后由 luzujia 于 2023-8-17 10:52 编辑

各位老师好,最近在摸索USPEX(Version 9.4.4,封装了MATLAB),在尝试跑例9(EX09)的时候,刚开始用修改后的submitJob_local.py提交,我对python不熟,只能按自己的理解把原来的脚本改了,改的地方如下图。checkStatus_local.py文件没有改。运行后发现只有CalcFold1里的任务是正常计算完成的,其它的CalcFold*都没有算就结束了。应该是提交脚本没有正确编辑,各位老师能帮我看看应该怎么改吗,两个原始版本的提交脚本已上传。

另外,我在一个博文里(科学网—关于天河二号运行USPEX的方法 - 耿华运的博文 (sciencenet.cn))看到如果USPEX和VASP在同一个节点内的话,可以将whichCluster设为0(无脚本运行)。用这种方法运行时发现此时所有的CalcFold*可以依次运行,但算完第一步就结束了(如图3)。而且后面好像还是要用到Submission文件夹里的脚本(因为有一次我把这个文件夹删除后运行,USPEX后面会自己重新拷贝回来)。大佬们知道是什么原因吗。最后,whichCluster的0和1选项好像可以在本地运行,这两者有什么区别呢。


origin.png (43.14 KB, 下载次数 Times of downloads: 18)

origin.png

tmp82DA.png (31.95 KB, 下载次数 Times of downloads: 22)

tmp82DA.png

3.png (16.47 KB, 下载次数 Times of downloads: 24)

3.png

checkStatus_local.py

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submitJob_local.py

1.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

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发表于 Post on 2023-9-7 22:27:37 | 只看该作者 Only view this author
请问楼主解决了吗?我最近也有这个问题

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-13 22:11:15 | 只看该作者 Only view this author
三天写出SCI 发表于 2023-9-7 22:27
请问楼主解决了吗?我最近也有这个问题

没解决。最后用10.3390/molecules28114471补充材料里的脚本跑通了算例

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发表于 Post on 2024-6-8 11:36:53 | 只看该作者 Only view this author
请问楼主搞明白0和1的区别了吗?我现在用0遇到了和您一样的问题。用1则无法正常运行,提交脚本报错,也不知道怎么改。

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发表于 Post on 2024-12-5 21:01:51 | 只看该作者 Only view this author
luzujia 发表于 2023-9-13 22:11
没解决。最后用10.3390/molecules28114471补充材料里的脚本跑通了算例

请问方便提供下这个脚本或者链接吗,我没有找到补充材料

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-6 15:20:07 | 只看该作者 Only view this author
忘川秋水 发表于 2024-12-5 21:01
请问方便提供下这个脚本或者链接吗,我没有找到补充材料

去文献官网找surporting information,仔细找找

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发表于 Post on 2025-4-16 15:44:44 | 只看该作者 Only view this author
docshen777 发表于 2024-6-8 11:36
请问楼主搞明白0和1的区别了吗?我现在用0遇到了和您一样的问题。用1则无法正常运行,提交脚本报错,也不知 ...

您好,请问您问题解决了嘛

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